一、温州医学院基因组医学研究院简介
根据国家战略需求和国际学科的发展趋势,温州医学院于2009年3月22日成立了基因组医学研究院(genomics.wzmc.edu.cn),旨在从功能基因组和表观基因组水平上研究复杂疾病发生发展的遗传基础和表观遗传机制,以及在疾病形成过程中,遗传和环境之间的交互作用,以期为提高我国疾病防控能力、提高人民健康水平、促进医药产业发展做出基础性、战略性和前瞻性的贡献。本院将依托于有良好样本资源、病理诊断技术先进的温州医学院及其附属医院,有效地整合并扩大温州医学院现有的疾病样本资源,建立起国内一流的生物样本收集库,并对这些样本进行深入、全面地全基因组相关分析和表观基因组学分析,建立起基于学校,面向全国开放的功能基因筛选平台、表观遗传学平台、转基因模式动物构建平台。并且,我们研究院借助新一代高通量测序技术,开展全基因组(包括基因组、转录组、microRNA、DNA甲基化)相关生物信息学分析和深入挖掘,已经在国际著名期刊发布论文(生物信息学软件、webserver以及数据库)数篇。正准备搭建全基因组相关信息分析的整合平台,为基因组信息全面、准确、方便以及系统的分析打下基础,为人类基因组的临床应用提供工具支持和技术保障。基因组医学研究院实行开放的、与国际接轨的管理体制和运行模式,加强与国内外大学及研究中心的合作,力争建设成为能够承担国家重大科研任务和国际合作项目的重要技术支撑平台!
孙中生博士,温州医学院基因组医学研究院院长。1982年于北京大学获得学士学位,1992年于美国德克萨斯州A&M大学获得博士学位,1993-1994年在德克萨斯州大学安德生癌症研究中心从事博士后研究,1994-1998年在美国贝勒医学院分子人类遗传学系从事博士后研究,1998-1999年任路易斯安那州立大学神经学中心助理教授、主任助理,并任生物化学和遗传系助理教授,1999-2005年任美国康奈尔大学助理教授、威尔医学院特护医学实验室主任医学,全 在线.提 供www.med126.com。主要研究方向为外周组织振荡器的生物钟基因在生理节律不同阶段的特定表达;免疫生理节奏的分子机制;研究生物钟基因mPer2如何调节学习和记忆行为。孙中生博士发现了哺乳动物关键的生物钟基因—mPer1和mPer2,该发现揭示了哺乳动物生物钟的分子生物学基础,文章发表国际权威的《CELL》杂志上,并被《Science》评为1997年度十大科学突破。到目前为止,发表的十三篇生物学方面的研究论文,被他人引用了1400多次。近几年开始从事表观基因组学研究,成功预测了基因组上所有的DNA甲基化功能区序列,运用自主研发的9K CGI芯片对恶性肿瘤、出生缺陷等疾病进行了大规模的DNA甲基化修饰研究,并且运用9K CGI芯片和Bisulfite测序对不同的甲基化DNA富集技术进行了系统的评价。
吴金雨博士,温州医学院基因组医学研究院研究组长(PI)。吴金雨博士长期从事基因组信息学研究,迄今已在已在Nucleic Acid Research、Bioinformatics、BMC Bioinformatics、BMC Genomics和Genomics等国际权威杂志以第一作者或通讯作者身份发表SCI论文20余篇,并曾多次被Nucleic Acid Research,Bioinformatics,Journal of Molecular Evolution和PLoS ONE等杂志邀请作为其审稿人。已经成功开发了一系列高度整合的比较基因组学分析平台,包括proTF,ArchaeaTF,cTFbase,PlasmoGF和FlyPhy等。随着新一代测序技术应用的不断拓展和带来的机遇和挑战,已经成功开发了新一代测序数据分析工具PGA4genomics,mirTools,MagicViewer,SplicingViewer,Exome-assistant,RRBS-analyser,mirTools 2.0,iMethy等。