本学科在科研上已形成了稳定的六个研究方向：临床病理学、免疫病理学、生殖内分泌病理学、血液病理学、神经病理学和糖尿病及并发症研究。近5年已完成和在研的课题有20余项，课题经费达300余万元，其中主持国家自然基金课题2项www.med126.com，主持省科技厅国际合作课题1项，主持、参与省自然科学基金课题3项，主持卫生厅、省教育厅、省中医药管理局及温州市人民政府、温州市科技局等课题20余项，发表论文近200篇，其中SCI收录20余篇，出版专著10余部,获省厅级科技成果奖7项。
本学科注重与国际的交流合作，2005年与美国洛克菲勒大学共同成立了温州医学院分子病理中心，并与耶鲁大学医学院、德克萨斯大学MD ANDERSON 肿瘤中心、纽约州立大学石溪医学院以及加拿大西安大略大学四所国际一流的医学院校在临床新技术的开展、人才培训以及科研方面建立了协作关系。
