温州医学院儿科学是国务院首批硕士学位授予点，1978年开始招收硕士生，2009年开始招收博士生，到目前为止已培养硕士生300余名。学科培养出一批活跃在国内外儿科学界的优秀人才如沈晓明、孙锟、陈超、林锦（美国)和赵伟（美国)等。本学科现有博士生导师3位，硕士生导师18位。
儿科学目前主要研究方向有儿科呼吸、新生儿、儿科心血管、儿童保健、儿童外科、儿科神经康复和儿科肾病等。其中，儿科（呼吸)、围产医学和儿科康复科是浙江省医学重点学科，儿童外科是浙江省医学重点扶植学科，中西医结合儿科（肾脏)是浙江省中医药重点扶持学科，儿科心血管、儿科神经是院级重点学科。
儿科学2003年和2005年两次被浙江省教育厅授予浙江省高校重点扶持学科，2006成为卫生部专科医师培训试点基地，学科基地为拥有450余张床位的温州医学院附属育英儿童医院，目前已成为浙南、闽北儿童医疗、保健中心。目前为中华医学会儿科学分会呼吸学组副组长，浙江省小儿外科分会主任委员单位及中华医学会小儿外科学分会肿瘤学组副组长单位医学全在线搜集整,理www.med126.com。国家食品药品监督管理局药物临床试验基地（儿科呼吸)、浙江省儿科呼吸、感染和免疫学组组长单位，温州医学院儿科研究所和浙江省小儿呼吸疾病诊疗研究中心挂靠本学科。
学科现有高级职称76人，具硕/博士学历者62人，浙江省“151人才工程”8人，浙江省中青年学科带头人4人，4人获浙江省高校青年教师资助。目前承担包括国家自然科学基金（7项)，浙江省自然科学基金（12项)、浙江省科技厅项目（6项)在内的各类课题90余项；近5年来20余项课题获得各级奖项，其中浙江省政府科技进步奖5项；主编和参编学术专著18本；发表SCI收录论文30余篇，中华系列论文120篇；入选《中华儿科杂志》发表论文最多单位奖（1978年至2006年，排名第11)。《儿科学》2004年被列入浙江省精品课程建设。
负责人李昌崇教授为中华医学会儿科呼吸学组副组长，中华医学会儿科学委员，浙江省高等学校教学名师，承担国家自然科学基金4项，获浙江省科学技术进步奖3项，发表SCI收录、中华系列论文30余篇，主编《儿童支气管哮喘基础与临床》（人民卫生出版社，2010年)，担任《儿科学》第七版（人民卫生出版社)编委，国家自然科学基金委员会的评审专家，《中华儿科杂志》等10余本杂志编委或常务编委。
