上海交通大学公共卫生学院由原上海第二医科大学公共卫生学院与人文社会科学部于2004年4月22日合并组成。学院（及其前身)经过近二十年的发展与专业调整，现有公共卫生、卫生管理、医药营销等学科群，已开设公共事业管理、市场营销（医药营销方向)二个本科专业；有社会医学与卫生事业管理、环境与劳动卫生以及食品与营养卫生三个硕士研究生学位授予点；并与上海交通大学安泰管理学院共同培养医院管理博士研究生。同时还承担了全校本科、研究生、成人教育等的公共课。学院还开展多学科、多形式的培训活动，中澳卫生管理教育研究培训中心、中美卫生政策与管理研究中心、上海市医疗保险培训中心、上海市全科医学培训中心、上海市青少年生殖健康培训中心挂靠在我院。
　　近几年来，学院形成了结构合理、实力较强的师资队伍，现有高级职称教师25人，其中博士生导师3人，硕士生导师6人。截至2005年底，学院已培养卫生管理专业本科毕业生300余人，硕士研究生50余人。毕业生分布在上海医疗卫生机构与卫生行政管理部门，相当大部分已成长为骨干力量。
　　近三年来，学院承担了世界卫生组织、国家发展与改革委员会、卫生部、国家自然科学基金以及国际合作项目等各类科研课题50余项。在核心学术刊物上发表学术论文百余篇，主编和协编教材20余部，有10人次担任卫生部规划教材的主编、副主编和编委。
　　学院积极开展对外交流与国际合作，与美国哈佛大学、波士顿大学、英国利物浦大学、澳大利亚蒙纳士大学、加拿大卡尔加里大学等著名院校建立了教学与科研合作关系。还成立了中美卫生政策与法律研究中心和中澳卫生管理教育、研究与培训中心。
　　学院主要领导：院长：蔡仁华；党总支书记：施榕；执行院长：马进；党总支副书记：秦美娇；副院长：程琦。