临床医学部始建于1956年，是在医学系的基础上发展而来的，她的前身为医疗系。医疗系是我院建立最早，规模最大的系。建系初期只设一个临床医学专业本科，每年招收学生240人左右，有一所附院医院供学生课间教学。随着学院的发展，根据我区医疗状况及培养特殊医疗专业人才的需要，医疗系增设了眼耳专科、口腔专科，临床医学专科等专业。1984年医疗系更名为医学系，负责医学本、专科教学管理和学生管理。近五年来学院办学规模不断扩大，招生人数逐年增加，原有的附属医院、教学医院已不能满足临床教学的需要。学院从工作实际需要出发，在总结兄弟院校成功经验的基础上实施了两段式教学模式，与此相适应医学系更名为临床医学部，其主要工作职责是“协调、督查、考核、评估”附属医院、教学医院的临床教学工作，以保证临床教学水平的不断提高，并协助学生处做好临床医学各专业本科进入课间教学和生产实习阶段的临床医学各专业本科管理工作。
经50年的发展壮大，临床医学部现有第一附属医院等十所课间教学医院；乌兰察布市中心医院等十九所生产实习医院。临床医学部现有临床医学、影像医学、麻醉医学、口腔医学四个本科专业(临床医学专业2006年评为自治区品牌专业)，有内科学、外科学等十个硕士学位授予点。
经过50年的发展临床医学部实力不断增强医学全.在.线www.med126.com，师资力量相当雄厚，现有专职教师199人，其中教授20人、副教授20人，讲师62人，助教97人；具有博士学位的教师22人，具有硕士学位的教师173人。临床医学部教学管理水平、学生管理水平不断提高，在教学管理研究工作上取得可喜成绩：共获的自治区级教学成果一等奖两项、二等奖四项、三等奖二项，列入自治区教学研究立项三项。在教学管理工作中，临床医学部坚持临床教学标准，要求各教学、附属医院严格按教学大纲、教学计划组织教学，主干学科考试由临床医。
学部依据试题库统一出题，统一判卷。临床医学部在实践中形成了自己的教学工作特色：一是在教学中充分体现现代教育思想和观念，即注重知识的传授和学生能力的培养，又重视加强学生综合素质的培养，努力使学生具有宽厚的理论知识和较强的实用能力；二是注重临床实践与基础理论的结合，重视新理论、新技术的介绍和应用，着力培养学生收集临床资料的基本功和初步治疗疾病的基本技能。三是十分重视外语教学，组建了临床外语教研室，由临床专业教师辅导专业外语阅读，大大提高了学生的外语水平。四是进一步加强对临床教学基地的建设，随着各附属医院、教学医院教学和学生的管理不断成熟，最终把附属医院、教学医院建成临床学院，使其成为办学的实体，担负起为自治区培养医药人才的重任。
