一、培育目标
培育目标分定向、不定向两种，定向是予先确定好要获得什么样的品种，然后有计划地进行培育，这种方法能在较短的时间里获得优良的品种。定向时有以细菌感受性为选育指标，如小鼠对沙门氏菌的感受性；也有采用遗传指标，如性成熟、初产日令、妊娠间隔、产仔数、哺乳量及离乳时体重等。不定向的是无意识的选择，预先交没有想要培育具有哪些特点的新品种，只是人们自然把比较有价值的留下，让它繁殖，去掉价值不大的品种，这样无意中起了选择的作用，这种选择过程是比较缓慢的，待纯化后回过头来做实验，测定其特性。
. 二、种鼠的选择（一)基础种群的选择
1．从野生鼠中选择。可能具有实验小鼠所没有的未知遗传特性，但由于野生鼠需要经过一段驯化时期，有时人工繁殖有困难，所有这种情况应加以考虑。
2．从起源于没有经过的新繁殖的近交群中选择。由于其个体之间存在着某种程度的遗传变异近亲繁殖和选择，把可能获得并需要的特性固定下来。
3．从杂交群中选择。这种杂交群包括，近交系与近交系之间；近交系与远交系之间；远交系与远交系之间；野生鼠与远交群之间的各种类型的杂交。尤其是“三元”即三个不同品系之间，“四元”即四个品系之间的杂交，有可能通过交配而形成多种的基因组合，从中选出具有一定特性的鼠种作为基础群。
4．如果其它实验室和保种单位有质量较好基础种群种子，并有相应的检测数据证实其确为好种子，也可直接引起，这样较为简便易行。但引进时必须了解和掌握必要的资料，如家谱号（Pedigreed No.)及其历史来源、交配方式、近交代数、遗传组成、生物学特性等。
（二)初代种鼠的选择
在选好基础 种鼠以后，进一步选出初代种群是极其重要的。
1．首先检查个体形态，如毛色、体型以及对外界刺激反应的敏感性等，有目的的选择后，即可进行繁殖。医学.全在线www.med126.com
2．对初代种群所产生的仔代，应进行病原微生物和药物感受性以及肿瘤诱发率等方面的检查，必须选留那些经过检查，而且有一定特性的双亲所生下的1～3胎仔鼠，作为下一代生产的种鼠。
3．第二代以后种群的选择。与选初代种群基本相同，但应注意二点：
（1)除注意其所需特性以外，还应注意其初产年龄、产仔数量、哺乳能力等方面的繁殖特性，应选择质量优良者。
（2)尽量在5～7代中选择具有所需特性的种鼠进行交配，因为5～7代是兄妹交配选择效果最好的代数，因此5～7代交配的组合尽可能大些，超过10代选择效果则较差。
