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授课题目 | 方差分析1和2 | 授课形式 | 讲授 |
授课时间 | 2006-10-12和10-16 | 授课学时 | 6 |
教学目的 与 要 求 | 1. 熟悉方差分析的基本思想及其适用条件; 2. 掌握完全随机设计、完全区组设计资料的方差分析及多个样本均数间的两两比较:LSD-t检验、Dunnett-t检验、SNK-q检验; 了解多组样本的方差齐性检验。 | ||
基本内容 | 1.方差分析的基本思想及适用条件 2.完全随机设计的单因素方差分析 1) 成组设计方差分析中变异的分解 2) 分析计算步骤 3.随机区组设计的两因素方差分析 1) 随机区组设计方差分析中变异的分解 2) 分析计算步骤 4.多个样本均数间的多重比较 1) LSD-t检验 2) Dunnett-t检验 3) SNK-q检验 5.了解多组样本的方差齐性检验 | ||
重 点 难 点 | 1(重点、难点)方差分析的基本思想:数据的总变异(总离均差平方和)按设计和需要分解成两个或多个组成部分,总自由度也相应分解 2(重点、难点)完全随机设计、随机区组设计、析因设计、重复测量资料方差分析中总变异、自由度的分解 3 主效应、单独效应、交互效应的概念,如何分析交互效应 4 介绍SNK、Dunnett、Bonfferoni等多重比较方法 5 方差分析的前提条件(正态性、方差齐),不符合条件时可以做数据变换、非参数统计方法或采用近似检验 | ||
主要教学 媒 体 | 多媒体投影仪 | ||
主 要 外 语 词 汇 | ANOVA | ||
有关本内容的新进展 | |||
主要参考资料或相关网站 | http://www.smmu.edu。cn/zykj/~statistics/index/index.htm 1. 徐勇勇主编. 医学统计学(第二版). 北京:高等教育出版社,2004 2. 杨树勤主编. 卫生统计学(第二版). 北京:人民卫生出版社,1991 3. 方积乾主编. 医学统计学与电脑实验(第二版). 上海:上海科学技术出版社,2001 4. 孙振球主编. 医学统计学(供研究生用). 北京:人民卫生出版社,2004 | ||
系、教研室 审查意见 | |||
课后体会 |
南方医科大学教案
教学内容 | 时间分配和 媒体选择 |
第一部分第一节 方差分析的基本思想1、方差分析的意义 2、方差分析的基本思想 3、方差分析的计算方法 4、方差分析的应用条件与用途 第二节 完全随机设计的单因素方差分析(one-way ANOVA)1、用途: 2、计算公式: 3、分析步骤(以例说明): 第二部分 第三节 随机区组设计的两因素方差分析(two-way ANOVA) 1、用途: 2、计算公式: 3、分析步骤(以例说明): 第四节 多个样本均数间的多重比较1、Newman-Keuls检验 2、最小显著差(LSD)t检验 小结 | 80分钟 40分钟 40分钟 40分钟 40分钟 |
讲稿
教学内容 | 时间分配 媒体选择 | ||||||||
一、方差分析的用途及应用条件 (一)用途 1、检验两个或多个样本均数间的差异有无统计学意义; 2、回归方程的线性假设检验; 3、检验两个或多个因素间有无交互作用。 (二)应用条件 1、各个样本是相互独立的随机样本; 2、各个样本来自正态总体; 3、各个处理组(样本)的总体方差方差相等,即方差齐。 二、 方差分析的基本思想 (一)方差分析中变异的分解 此类资料的变异,可以分出三种: 1、总变异:表现为所有数据大小不等,用总的离均差平方和表示,记为SS总。 (i 代表第i个组, j代表第j个观察值) 的大小还与总例数N有关,确切讲是与总的自由度有关, =N-1。 2、组间变异:组间变异表现为各组均数大小不等,描述其大小指标 (1)用各组均数与总均数X的离均差平方和表示,记为SS组间,SS组间的大小与处理因素的作 用、随机误差(测量误差和个体差异)和组间自由度有关。 , (2)用SS组间 除于组间自由度表示,称组间均方
组间均方反映处理因素和随机误差的作用。 3、组内变异:组内变异表现为各组内部各个观察值大小不等。描述其大小指标: (1)用各组内部每个观察值与组均数X的离均差平方和表示,记为SS组内。SS组内的大小与随机误差(测量误差和个体差异)和组内自由度有关。 , (2)用SS组内除于组内自由度表示,称组内均方
组内均方只反映观察值的随机误差(个体差异及随机测量误差)。 三种变异的关系: SS总=SS组内+SS组间 , (二)方差分析思想 1、如果两个或多个样本来自同一个总体,或者处理因素的效应一样(没有差异),则组间和组内的变异相等,即: MS组间 =MS组内 或两者相差不大,它们的比值用F表示:
则F=1, 或F与1相差不大。 2、若两个样本或多个样本来自不同总体,或者处理因素的效应不一样,则组间变异大于组内变异,即: MS组间>MS组内 则F值明显大于1。要大到多大程度才有统计学意义?按和查F界值表,由F值确定P值,按P值大小作出推断。 方差分析基本思想:在方差分析时,根据资料的设计类型不同,将总的离均差平方和及自由度分解为两个或多个部分,除随机误差外,其余部分的变异反映处理因素的作用,通过比较不同来源的均方,借助F分布原理作出统计推断,从而了解处理因素对观测指标有无影响。 三、单因素方差分析 (一)计算方法 单因素方差分析的计算公式 变异来源 SS υ MS F
组间 k-1 组内(误差) SS总 - SS组间 N-k 总 N-1 会计资格* 四、分析步骤 1、建立假设和确定检验水准; H0: H1: 不等或不全相等
2、计算检验统计量F值 表9-15 例9-16 方差分析结果 变异来源 SS υ MS F P 组间 2.0276 3 0.6759 10.24 <0.01 组内 0.7918 12 总 2.8194 15 3、确定P值和推断结论 以组间自由度为,以组内自由度为,查附表3,F界值表:=3.49,由于, 故P<0.05; 按,拒绝H0,接受H1, 可以认为四组均数不等或不全相等。 注意:以上仅是总的结论,尚需对四个样本均数进行两两比较(见后)。 五、 多个样本均数的两两比较-q检验 多个样本均数比较经F检验后,若得出有统计学意义的结论后,要进一步推断哪些组之间有差别,哪些组之间没有差别,还是所有各组之间都有差别,要解决这些问题,就要进一步做均数间的两两比较了。 多个样本均数间的两两比较又称多重比较,由于涉及的对比组数大于2,就不能应用前面介绍的t检验,只能使用下面介绍的方法。 若仍用前述前述的t检验方法,对每两个对比组作比较,会使犯第一类错误(拒绝了实际上成立的H0所犯的错误)的概率α增大,即可能把本来无差别的两个总体均数判为有差别。 (一)检验统计量q的计算公式为:
式中 为两个对比组的样本均数。为方差分析中算得的组内均方),和 分别为两对比组的样本例数。q检验适用于多个均数间的两两比较。 (二) q检验的方法步骤 对例9-16资料作两两比较。 1、建立假设 H0:任两对比组的总体均数相等,即 H1:任两对比组的总体均数不等,
2、选择检验方法,计算统计量q
将四个样本均数从大到小顺序排列,并编上组次: 组次 1 2 中国卫生人才网3 4 均数 3.3200 3.0975 2.6850 2.4025 组别 D C B A
列出两两比较计算表,见表9-17 表9-17 四个样本均数两两比较的q检验 对比组 两均数之差 标准误 q值 组数 q界值 P A与B a 0.05 0.01 (1) (2) (3) (4)=(2)/(3) (5) (6) (7) (8) 1与4 0.9175 0.1285 7.140 4 4.20 5.50 <0.01 1与3 0.6350 0.1285 4.942 3 3.77 5.05 <0.05 1与2 0.2225 0.1285 1.732 2 3.08 4.32 >0.05 2与4 0.6950 0.1285 5.409 3 3.77 5.05 <0.01 2与3 0.4125 0.1285 3.210 2 3.08 4.32 <0.05 3与4 0.2825 0.1285 2.198 2 3.08 4.32 >0.05 3、确定P值,判断结果 由表9-17中第8栏可以知道,除了第1组与第2组以及第3组与第4组之间差别没有显著性外,其他组间差别均有显著性差异。 六、LSD-t检验(最小显著差异t检验,Least significant difference) LSD-t检验适用于某一对或几对在专业上有特殊价值的均数间的比较。 统计量计算公式为:
七、Dunnett-t检验 Dunnett-t检验适用于k-1个实验组与一个对照组均数差别的多重比较。 统计量计算公式为:
几种方法的敏感性比较:LSD>Dunnett>SNK>Tukey>Scheff。 八、随机区组设计/配伍组设计资料的方差分析(two-way ANOVA) 1、随机区组设计 相当于配对设计的扩大。具体做法是将受试对象按性质相同或相近者组成b个单位组(配伍组),每个单位组中有k个受试对象,分别随机地分配到k个处理组。这种设计使得各处理组受试对象数量相同,生物学特点也较为均衡。由于减少了误差,试验效率提高了。
例A:为研究注射不同剂量雌激素对大白鼠子宫重量的影响,取4窝不同种系的大白鼠(b=4),每窝3只,随机地分配到3个组内(k=3)接受不同剂量的雌激素的注射,然后测定其子宫重量,问注射不同剂量的雌激素对大白鼠子宫重量是否有影响? 解: 1. 建立假设、确定检验水准 H0:m1= m2= m3雌激素对大白子宫重量无影响 H1: m1、 m2、 m3不相等或 不全相等 a=0.01 2. 计算检验统计量F 随机区组设计的方差分析表
3. 确定P 值、下结论 Ø 处理间差别的推断:v处理 = 2,v误差 = 6,查表得F 0.01,2,6=10.92,因P <0.01,按a =0.01水准拒绝H0,故可认为三个剂量组对大白鼠子宫重量有影响。 Ø 配伍组间差别推断:F0.01,3,6=9.78,配伍组间P<0.01,按a=0.01水准拒绝H0,故认为各配伍组间的总体均数有差别。此设计将配伍组间变异从组内变异中分解出来,减少了误差,较之完全随机设计,试验效率提高了。 Ø 如果F配伍<1 , MS配伍<MS误差 ,配伍设计无效(或曰无必要进行配伍设计); Ø 应将SS配伍与SS误差合并, v配伍与 v误差合并,计算出新的MS误差’,并计算新的F值,再查F 界值表,下结论。 F处理=MS处理/MS误差 F处理’= MS处理/ MS误差’ 九、小结 • ANOVA的基本思想 • 完全随机设计和配伍组设计的不同 • 各变异间的关系 • 常用的均数间两两比较的方法 | 15’ 投影 15’ 15’ 投影 15’ 15’ 投影 15’ 15’ 投影 15’ 15’ 投影 15’ 15’ 投影 15’ 15’ 投影 15’ |