将学科的优势转化为教学的优势，科研反哺教学。
学校拥有生物学的一级学科“生物化学与分子生物学”，具有博士、硕士学位授予权和药学博士后流动站。可以说《药学的生物化学基础》背后拥有雄厚的生物学科和生物制药的教学、科研实力和丰富的办学经验的支持。学校分二期扩大了现有理科基地生物化学实验室和分子生物学实验室，投资了48.48万元购置了常压柱层析系统、HPLC、酶标仪，超声波细胞粉碎机、紫外分析仪和蛋白、核酸电泳仪、高速冷冻离心机、微量取样器、PCR仪等大型实验教学用仪器使实验能够从功能基因的克隆出发，进行表达、调控，目标产物的分离纯化、以及药物大分子的性质、结构与功能研究，并与合理药物设计相衔接，形成鲜明的药学特色，为《药学的生物化学基础》的实验提供了有力的保证。实验室还逐步从实验课程教学实验室过渡到向理科基地开放的学生实验室，鼓励学生进行自主选题和研究。
同时为了使学生能够尽早地接触科研工作，理科基地学生从三年级开始逐步参与到老师的研究课题中，并进行科研岗位轮换制度。学生本科实习阶段，就能进入像中科院上海生化所、中科院上海有机所、上海医工院等国内一些知名的基础科学研究机构以及校内建立的国家级、省部级重点实验室如国家酶工程中试实验基地和新中新药研究中心，计划生育药物研究中心，海洋药物研究中心。基地学生在本科阶段通过“第七学期科研轮训”和毕业实习，能够较早的参与教师的科研课题研究，有些科研课题还是国家重大科研项目，并得到了优秀的科研工作人员的指导，较早接触了学科高水平的实验室和精密仪器，为今后的科学研究打下良好的基础。
教学组充分利用学科科研能力强、学术队伍的人才优势，为《药学的生物化学基础》的本科教学服务。教学组的主要成员均承担了“国家十五重大专项课题”和“国家自然科学基金项目”，他们将科学研究中的前沿进展和最新成果与教学内容相结合，不断更新课程内容，使学生能够及时了解学科动态。起到了科研反哺教学的作用。 

教材建设特色化、配套化、系列化，实验教材更加注重培养学生的综合科研素质。

教学组采用了最新出版的由吴梧桐教授主编的《生物化学》第五版（被列为国家级“十五”规划教材，由人民卫生出版社出版)，在对生物化学知识结构讲授上进行了重新调整，除了基本生物化学理论知识外，还增加了“生物药物与基因工程药物”、“药学研究的生物化学基础”二章，这也为学生以后学习分子生物学课程打下了深厚的基础，并针对基础药学理科基地人才培养目标和教学重点编写了《药学的生物化学基础》补充教材和《生物技术药物学》（被列为国家级“十五”规划教材，由高等教育出版社正式出版)。结合理科基地生物化学教程，同时还编写了《药物的生物化学习题集》一书，为学生在课外巩固生物化学知识做准备。本着科学性，先进性和效益性的原则,重新编写了一本供理科基地学生使用的《药学的生物化学基础实验大纲》和《药学的生物化学实验讲义》，将实验内容重组调整为基础实验和综合性实验两部分，将综合性与专一性相统一，每个实验即能体现生化知识的连贯性，又能反应实验在生化的独立性，同时将验证性的反应包含在其中。尤其在最后考核实验的设立，让学生从查阅资料开始，一步一步走进如何进行科研的道路，对学生的综合素质有很好的培养效果。

举办多种形式的科技讲座和学术沙龙，激发学生自主学习的热情。

生物化学的理论研究发展是十分迅速的，每一项新的研究都与药学有着十分密切的关系，将这些新的研究成果及时介绍给学生是十分必要的。因此在《药学的生物化学基础》的教学中，教师除了在课堂上及时给学生补充，如“人类基因组计划研究成果与未来药学研究的关系”等科学进展和动态外，还给学生布置了一些如“转基因动、植物与药学”、“克隆动物与医药研究”、“记忆与哪些生物大分子相关”等的课外小课题，让学生自己查阅资料，在教师的组织参与下举办课外的“生化知识沙龙”进行交流。此外，学校投资建设了理科基地专用借阅书架，教师推荐了许多生化类的新书、新杂志上架，以供学生查阅使用。在电子阅览室里，学生可以查询药学信息检索资料，备有的专业光盘数据库、电子图书和网上检索业务帮助学生自由的畅游在生命科学知识的海洋里。

利用举办国际会议的契机，学校聘请了Mark Alan.Wisniewskis,Craig C.Conrad,

Tadashi.Yoshimoto等国外学者为学生做《Biologics Contract Manufacturing Market Challenge and Opportinities》、《International Interectual Property Basics》、《Structure Biology of Proline Spec医学招聘网ific Peptidases for Drug Design》等学术讲座，通过为综合素质加分的办法鼓励学生积极参与讲座。

双语实验教学提高了学生专业英语水平，成为课程改革的亮点。

《药学的生物化学基础》配套使用的双语实验教材《生物化学实验与指导》和《分子生物学实验与指导》是国内药学教育界第一套正式出版双语系列实验教材之一，列入国家“十五”规划教材。实验课教师授课、板书均使用英语，学生撰写实验报告和实验讨论全部使用英文。教材的更新、教师专业英语水平的提高，激发了学生对专业英语学习的热情和求知欲，提高了他们的英语水平。理科基地学生本科阶段就能比较轻松的查阅国外资料，部分优秀学生还能使用英文撰写文献综述，并用流利的英语进行课题汇报和答辩。

实验教学环境的完善保障了高质量实验教学。

学校分二期扩大了现有理科基地生物化学实验室和分子生物学实验室，投资了48.48万元购置了常压柱层析系统、HPLC、酶标仪，超声波细胞粉碎机、紫外分析仪和蛋白、核酸电泳仪、高速冷冻离心机、微量取样器、PCR仪等大型实验教学用仪器使实验能够从功能基因的克隆出发，进行表达、调控，目标产物的分离纯化、以及药物大分子的性质、结构与功能研究，并与合理药物设计相衔接，形成鲜明的药学特色，为《药学的生物化学基础》的实验提供了有力的保证。实验室还逐步从实验课程教学实验室过渡到向理科基地开放的学生实验室，鼓励学生进行自主选题和研究。同时为了使学生能够尽早地接触科研工作，理科基地学生从三年级开始逐步参与到老师的研究课题中，并进行科研岗位轮换制度。

学生本科实习阶段，就能进入像中科院上海生化所、中科院上海有机所、上海医工院等国内一些知名的基础科学研究机构以及校内建立的国家级、省部级重点实验室如国家酶工程中试实验基地和新中新药研究中心，计划生育药物研究中心，海洋药物研究中心。

网络教学环境硬软件建设同时抓，为学生自主学会计资格习的提供保障

《药学的生物化学基础》课程从2004年起就建立了课程网站，教师将国内外优秀的教育网站和生命科学主题网页链接在课程网站里，提供了参考文献、指导教材和专题讲座，教师部分课件挂在网站内供学生浏览学习。