教 案 首 页
课程名称 | 生物化学 | 年级 | | 专业、层次 | 本科临床医学类 | |||||||
授课教师 | | 职称 | | 课型(大、小) | 大 | 学时 | 3 | |||||
授课题目(章、节) | 第二章 核酸的结构与功能 | |||||||||||
教材名称 | 《生物化学》第七版 | |||||||||||
作者 | 查锡良 | 出版社 | 人民卫生出版社 | |||||||||
主要参考书 (注明页数) | (英)内德尔 主编. 核酸结构原理. 北京: 科学出版社,2008 | |||||||||||
目的与要求: 1. 掌握: 核苷酸的组成成分,碱基、戊糖和磷酸。核酸一级结构的概念。多核苷酸链中单核苷酸的连接方式。DNA碱基组成及其特点(Chargaff规则)。DNA双螺旋结构(DNA二级结构)的要点。DNA的功能。真核生物mRNA一级结构的特点及生物学功能,tRNA二级结构的特点及生物学功能。DNA变性与复性。核酸分子杂交的原理。核酸酶及限制性核酸内切酶的概念。 2. 熟悉: DNA的超螺旋结构及其在染色质中的组装。tRNA一级结构和三级结构的特点。rRNA的种类及核蛋白体的构成。核酸的一般理化性质。DNA的解链曲线。Tm的影响因素。 3. 了解:碱基的酮式-烯醇式互变异构。 DNA双螺旋结构的多态性。snmRNAs。核酶(ribozyme)的概念。核酸酶的分类。 | ||||||||||||
教学内容与时间安排、教学方法: 1.教学内容与时间安排 核酸的化学组成及一级结构 0.5学时 DNA的空间结构与功能 1学时 RNA的结构与功能 1学时 核酸的理化性质及核酸酶 0.5学时 2. 教学方法: 讲授+演示+启发+讨论。 | ||||||||||||
教学重点及如何突出重点、难点及如何突破难点: 1. 重点:DNA双螺旋结构(DNA二级结构)的要点。 真核生物mRNA一级结构的特点。DNA变性与复性。核酸分子杂交的原理。 2. 难点: 核苷酸的组成成分。DNA双螺旋结构。真核生物mRNA一级结构。 3. 课件色彩及语言强调突出重点;采用图片及动画演示理解难点。 | ||||||||||||
教研室审阅意见: 同意。 教研室主任签名:李洪 2009 年2 月 28 日 | ||||||||||||
基 本 内 容 | 课堂设计和时间安排 | |||||||||||
第二章 核酸的结构与功能 核酸的分类和功能。 第一节 核酸的化学组成和一级结构 一、核苷酸是构成核酸的基本单位: (一)含氮碱: ☆嘧啶碱(pyrimidine)的化学结构和类型,嘧啶环的原子编号。嘌呤碱(purine)的化学结构和类型,嘌呤环的原子编号。 (二)戊糖与核苷(pentose and nucleoside): 核糖与脱氧核糖的化学结构与原子编号。 ☆核苷的化学结构与命名。 含氮碱与戊糖的连接方式与化学键。 (三)核苷酸的结构与命名(structure and nomenclature of nucleotide): ☆核苷酸的化学结构。 核苷酸由于与磷酸基缩合的位置不同而分别生成2"-核苷酸、3"-核苷酸和5"-核苷酸。最常见的核苷酸是5"-核苷酸(5"常被省略)。5"-核苷酸又可按其在5"位缩合的磷酸基的多少,分为一磷酸核苷(核苷酸)、二磷酸核苷和三磷酸核苷。 ☆环核苷酸的分子结构。 核苷酸的命名及缩写符号。 二、核酸的一级结构是核苷酸的排列顺序: 核酸就是由许多核苷酸单位通过3",5"-磷酸二酯键连接起来形成的不含侧链的长链状化合物,称为多核苷酸链。 3",5"-磷酸二酯键的形成。 核酸是具有方向性的长链状化合物,多核苷酸链的两端,一端称为5"-端,另一端称为3"-端。 DNA分子主要由dAMP、dGMP、dCMP和dTMP四种脱氧核糖核苷酸所组成。DNA的一级结构就是指DNA分子中脱氧核糖核苷酸的排列顺序及连接方式(3",5"-磷酸二酯键)。 RNA分子主要由AMP,GMP,CMP,UMP四种核糖核苷酸组成。RNA的一级结构就是指RNA分子中核糖核苷酸的排列顺序及连接方式。 核酸一级结构的表示方法。 第二节 DNA的空间结构与功能 一、 DNA的二级结构——双螺旋结构模型: DNA双螺旋结构是DNA二级结构的一种重要形式,它是Watson和Crick两位科学家于1953年提出来的一种结构模型(获1962年度诺贝尔奖)。 (一)对DNA双螺旋结构模型作出贡献的科学家: Oswald Avery (1877-1955);Erwin Chargaff (1905-2002);Linus Pauling (1901-1994);Rosalind Franklin (1920-1958);Maurice Wilkins (1916-2004 );James Dewey Watson (1928- );Francis Crick (1916-2004 )。 ☆Chargaff 研究小组的贡献:① DNA碱基组成有物种差异,且物种亲缘关系越远,差异越大;② 相同物种,不同组织器官中DNA碱基组成相同,而且不因年龄、环境及营养而改变;③ DNA分子中四种碱基的摩尔百分比具有一定的规律性,即A=T、G=C、A+G=T+C。这一规律被称为Chargaff规则。 (二)DNA双螺旋结构模型(double-helix model of DNA): DNA双螺旋结构可分为A、B、C、D及Z型等数种,除Z型为左手双螺旋外,其余均为右手双螺旋。 B型DNA双螺旋结构模式图。 ☆★B型双螺旋DNA的结构特征:① 为右手、反平行双螺旋;② 主链位于螺旋外侧,碱基位于内侧;③ 两条链间存在碱基互补:A与T或G与C配对形成氢键,称为碱基互补原则(A与T为两个氢键,G与C为三个氢键);④ 螺旋的稳定因素为氢键和碱基堆砌力;⑤ 螺旋的螺距为3.4nm,直径为2nm。 (三)DNA双螺旋结构的多态性: 除B构象之外,DNA的二级结构还包括右手双螺旋结构的A构象、C构象和D构象等多种构象,以及左手双螺旋结构的Z构象。 二、DNA的高级结构是超螺旋结构: (一)原核生物DNA的高级结构: 绝大多数原核生物的DNA都是共价封闭的环状双螺旋。如果再进一步盘绕则形成麻花状的超螺旋结构。 (二)DNA在真核生物细胞核内的组装: 在真核生物中,双螺旋的DNA分子围绕一蛋白质八聚体进行盘绕,从而形成特殊的串珠状结构,称为核小体(nucleosome)。 核小体的结构。 三、DNA是遗传信息的载体: DNA的基本功能是作为遗传信息的载体,为生物遗传信息复制以及基因信息的转录提供模板。 ☆DNA分子中具有特定生物学功能的片段称为基因(gene)。 ☆一个生物体的全部DNA序列称为基因组(genome)。 基因组的大小与生物的复杂性有关,如病毒SV40的基因组大小为5.1×103bp,大肠杆菌为5.7×106bp,人为3.2×109bp。 第三节 RNA的结构与功能 RNA通常以单链形式存在,但也可形成局部的双螺旋结构。 RNA分子的种类较多,分子大小变化较大,功能多样化。 主要的RNA种类有rRNA、mRNA、tRNA、HnRNA、SnRNA、SnoRNA、ScRNA等。 一、mRNA是蛋白质合成的模板: mRNA可形成局部双螺旋结构的二级结构。 mRNA在真核生物中的初级产物称为hnRNA,经剪接过程转变为成熟的mRNA。 大多数真核成熟的mRNA分子具有典型的5"-端的7-甲基鸟苷三磷酸(m7GTP)帽子结构和3"-端的多聚腺苷酸(polyA)尾巴结构。 mRNA分子中带有遗传密码,其功能是为蛋白质的合成提供模板(template)。 ☆mRNA分子中每三个相邻的核苷酸组成一组,在蛋白质翻译合成时代表一个特定的氨基酸,这种核苷酸三联体称为遗传密码(codon)。 二、tRNA是蛋白质合成的氨基酸载体: tRNA是分子最小,但含有稀有碱基最多的RNA,其稀有碱基的含量可多达20%。 tRNA是保守性最强的RNA。 tRNA是单链核酸,但其分子中的某些局部也可形成双螺旋结构。 (一)tRNA的二级结构: ☆★tRNA的二级结构由于局部双螺旋的形成而呈现“三叶草”形,故称为“三叶草”结构。①氨基酸臂——携带氨基酸;②DHU臂——辨认并结合氨基酰tRNA合成酶;③反密码臂——识别mRNA上的密码;④可变臂;⑤TΨC臂——识别并结合核糖体。 (二)tRNA的三级结构。 三、以rRNA为组分的核糖体是蛋白质合成的场所: rRNA是细胞中含量最多的RNA,占总量的80%。rRNA与蛋白质一起构成核糖体(核蛋白体),作为蛋白质生物合成的场所。 大肠杆菌16S rRNA的二级结构。 四、snmRNA参与基因表达调控: 细胞内不同部位存在的其他种类的小分子RNA统称为非mRNA小RNA(snmRNA)。 RNA组学主要研究细胞中snmRNA的种类、结构与功能。 snmRNA的主要功能是参与基因表达的调控。 某些小分子RNA具有催化特定RNA降解的活性,这种具有催化作用的小RNA被称为核酶(ribozyme)。 核酶通常具有特殊的分子结构,如锤头结构。 第四节 核酸的理化性质 一、核酸能吸收紫外光: 核酸具有酸性;粘度大;能吸收紫外光,最大吸收峰为260nm。 故常用紫外分光光度法测定核酸的含量。 二、DNA变性是双链解离为单链的过程: ☆在理化因素作用下,DNA双螺旋的两条互补链松散而分开成为单链,从而导致DNA的理化性质及生物学性质发生改变,这种现象称为DNA的变性(denaturation)。 引起DNA变性的因素主要有:①高温,②强酸强碱,③有机溶剂等。 Dwww.med126.com/wsj/NA变性后的性质改变:① 增色效应(hyperchromic effect):指DNA变性后对260nm紫外光的光吸收度增加的现象;② 旋光性下降;③ 粘度降低;④ 生物学功能丧失或改变。 ☆加热DNA溶液,使其对260nm紫外光的吸收度突然增加,达到其最大值一半时的温度,就是DNA的变性温度(融解温度,melting temperature, Tm)。 Tm的高低与DNA分子中G+C的含量有关,G+C的含量越高,则Tm越高。 三、DNA的复性与分子杂交: 将热变性后的DNA溶液缓慢冷却,在低于变性温度约25~30℃的条件下保温一段时间(退火,annealing),则变性的两条单链DNA可以重新互补而形成原来的双螺旋结构并恢复原有的性质。 将变性DNA经退火处理,使其重新形成双螺旋结构的过程,称为DNA的复性。 ☆两条来源不同的单链核酸(DNA或RNA),只要它们有大致相同的互补碱基顺序,经退火处理即可复性,形成新的杂种双螺旋,这一现象称为核酸的分子杂交(hybridization)。 核酸杂交可以是DNA-DNA,也可以是DNA-RNA杂交。 不同来源的,具有大致相同互补碱基顺序的核酸片段称为同源顺序(homologous sequence)。 在核酸杂交分析过程中,常将已知顺序的核酸片段用放射性同位素或生物素进行标记。 带有一定标记的已知顺序的核酸片段称为探针(probe)。 第五节 核酸酶 凡是能水解核酸的酶都称为核酸酶(nuclease)。 凡能从多核苷酸链的末端开始水解核酸的酶称为核酸外切酶。 凡能从多核苷酸链的中间开始水解核酸的酶称为核酸内切酶。 ☆能识别特定的核苷酸顺序,并从特定位点水解核酸的内切酶称为限制性核酸内切酶(限制酶,restriction enzyme)。
| ☆——重点 ★——难点 0.5学时
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演示+设问 ----------------- 1学时
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设问+重点强调 举例
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小 结 | 1. 核酸的化学组成。核酸一级结构的概念。 2. DNA的二级结构特点。 3. 真核生物mRNA一级结构的特点。 4. tRNA二级结构的特点及功能。 5. 核酸的变性与复性。核酸的分子杂交。 6. 限制性核酸内切酶的概念。
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复 习 思 考 题 、作 业 题 | 一、名词解释 1. 核苷酸;2.DNA的二级结构;3. 核酸的分子杂交;4. DNA的变性;5. 融解温度;6. 限制性核酸内切酶;7. 核酶。 二、问答题 1. 请描述tRNA二级结构的特征及其功能。 2. 论述国家医学考试网DNA二级结构的特点。
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下 次 课 预 习 要 点 | 第三章 酶 1. 酶的概念。酶与一般催化剂的共同点及特点。 2. 酶的化学组成。酶的辅助因子,辅酶(辅基)和金属离子。维生素的概念和种类。B族维生素的化学结构与生理功能。 3. 酶的活性中心。
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实 施 情 况 及 分 析 | | |||||||||||