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《第三军医大学学报》是经中国人民解放军总政治部、国家科技部及国家新闻出版署批准，由第三军医大学主管、主办，国内外公开发行的综合性医药卫生类学术刊物。
《第三军医大学学报》创刊于1979年，现为半月刊。版本采用国际标准210mm×297mm开本，国内统一刊号：CN50-1126/R,国际标准刊号：ISSN1000-5404。国内邮发代号：78-91，国外代号：M6529。主要栏目设有：专家论坛、论著（军事医学、基础医学、临床医学、药学、预防医学、检验医学、生物医学工程等)、技术方法、研究快报、短篇论著、经验交流、疑难病例、个案与短篇和学术之窗。现任主编为钱桂生教授。
《第三军医大学学报》创刊至今，坚持正确的办刊宗旨，以质量特色求生存，以社会效益求发展，在传播新理论、交流新经验、推广新技术、普及新知识等方面作出了积极贡献。近年来，刊文地区分布数已达到31个，涉及国内外机构159个，涵盖了生物医学的全部学科，各类基金资助项目论文占每期刊出论著的63%左右。刊出的论文被引用率和学报的影响因子也逐年上升，据2015版《中国科技期刊引证报告》（核心版)数据显示，《第三军医大学学报》2015年度的影响因子为0.587，总被引频次为2901。综合评分在全国医科大学学报类54种期刊中列第2位。
《第三军医大学学报》是中国被引频次最高的500种科技期刊之一。自1989年以来，《第三军医大学学报》先后20余次获全国、全军、教育部和省、市优秀科技期刊一、二等奖，2003年、2005年两度被评为“国家期刊奖百种重点科技期刊奖”（该奖项为中宣部、国家新闻出版总署和国家科技部共同评选的我国期刊界的最高奖项)。2008-2012、2015年6次荣获“百种中国杰出学术期刊”称号，2008、2010、2011连续3届评为“中国精品科技期刊和被教育部科学技术司“中国高校精品科技期刊”。
《第三军医大学学报》收录情况：
CA 化学文摘(美)(2014)
JST 日本科学技术振兴机构数据库(日)(2013)
Pж(AJ) 文摘杂志(俄)(2014)
CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(2015-2016年度)(含扩展版)
北京大学《中文核心期刊要目总览》来源期刊： 1992年(第一版), 1996年(第二版), 2000年版, 2004年版, 2008年版, 2011年版, 2014年版
