南京医科大学第二临床医学院于2007年1月19日新设立在南京医科大学第二附属医院，坐落于南京挹江门明城封闭墙边美丽的小桃园湖畔，环境优美，与著名的阅江楼遥相守望。
 
　　 　　 　　学院与医院实行一体化管理，医院占地面积 28520平方米，建筑面积52044平方米。医院分本部与东院，共有开放床位近千张，是南京医科大学临床教学基地和江苏省首家全科医师培训基地。医院设有40个临床科室，20个医技科室，10个教研室。其中，消化医学中心系国家级内镜诊疗技术培训基地，南医大内镜研究所也设在该中心，儿科、内分泌科、消化内科为江苏省省级临床重点专科；小儿肾脏病的研究和治疗处于国内领先地位，消化内科和肿瘤科为南医大“十一五”期间的重点学科，神经内科、妇产科、普外科、烧伤整形外科等均在省内外享有较高声誉。学院荟萃着许多知名医学专家，拥有一批学科带头人和骨干教师，现有高级职称122人、中级职称239人、博士21人、硕士70人、硕士生导师28人、享受国务院特殊津贴7人，其中一批年富力强的中青年专家被选定为省“135工程”及“333工程” 医学重点人才。近年来医院共承担了国家、省厅级科研项目90多项；获得部、省、厅科技进步奖19项；编写专著及教材30余部。平均每年在国家、省级刊物发表论著200余篇；参加国际、全国及省级学术会议交流论文数十篇。  医学全在.线提供
　　　　　　作为南京城西北地区唯一一家省属三级综合性医院，医院坚持“人才、服务、经营、创新、数字化” 的建设发展理念；坚持人才战略、高科技、高发展；坚持认真经营，内提高素质、外树立形象。尤其在 2001年初医院开全省医院之先河，实施“病人选医生”的举措，让老百姓对医院的满意度有了很大的提高。近5年来在江苏省卫生厅组织的综合目标管理责任制考核中，医院一直名列前茅。医院一贯重视教学工作，能正确处理医、教、研关系，在医院各项工作中，教学工作占有着重要位置，不断加大对教学的投入，明显改善了教学环境与条件。建立了现代化的多功能厅、技能训练中心、多媒体教室、网络中心 、示教室等教学基础设施。