国家级重点学科3个：
（1)中西医结合临床　（总医院)
（2)肿瘤学　　　　　（肿瘤医院)
（3)泌尿外科　　　　（二院)  

天津市重点学科9个：
（1)内分泌与代谢病　　　　（天津市教委、卫生局批准)
（2)神经外科学与神经病学　（天津市教委、卫生局批准)
（3)影像医学与核医学　　　（天津市教委批准)
（4)微生物学与免疫学　　　（天津市教委批准)
（5)病理学与病理生理学　　（天津市教委批准)
（6)生物医学工程　　　　　（与天津大学联合建设，天津市教委批准)
（7)心血管病学　　　　　　（天津市卫生局批准)
（8)普通外科　　　　　　　（天津市卫生局批准)
（9)核医学　　　　　　　　（天津市卫生局批准)

天津市重点发展学科2个：
（1) 眼科学　　（天津市教委批准)
（2) 口腔修复　（天津市卫生局批准)

国家药品临床研究基地情况：

总医院6个专业：心血管、消化、内分泌、呼吸、神经、皮肤
第二医院3个专业：抗感染、心血管、眼科
基础医学院：临床药理研究室
附属肿瘤医院1个专业：肿瘤