2006年，军事预防医学随公共卫生与预防医学一级学科硕士授权成为研究生培养二级学科。该学科以预防医学系预防医学教研室为基础进行研究生培养，现有教师6人，其中教授3人，副教授1人；本院硕士研究生导师2人，博士毕业，中国人民解放军军事医学科学院聘任的博士研究生导师1人。军事预防医学专业可招收现役军人，与军事医学科学院联合培养。目前承担的各类研究课题6项，科研经费数十万元。
本学科2008年计划招收硕士研究生2名，主要研究方向为：军队医学应激与救援、军队传染病防治。