黑龙江中医药大学始建于1954年，经半个多世纪的建设与发展，学校已成为具有较高教学、科研、医疗水平，在国内外有一定影响的高等中医药院校，现为黑龙江省重点建设的高水平大学。学校于2004年获得全国首批教育部本科教学工作水平评估优秀结论，2007年全国首家通过教育部本科中医学专业认证单位，2008年被确定为国家中医临床研究基地建设单位，2009年晋升全国精神文明建设工作先进单位。
学校地处风光秀丽的北国名城哈尔滨市，校园环境优雅，绿树成荫，建筑中西合璧，风格独特，教学主楼和礼堂为典雅的欧式建筑，属国家级保护建筑；校园内21尊古代著名中医药学家雕像以及“经方小道”等，形成了独具特色的中医药文化园——“大医之路”。
学校下设9个学院、8个附属医院（6个非直属)、1个研究院、26个教学医院和85个实习基地。有17个学科具有博士学位授予权，28个学科具有硕士学位授予权。设有18个本科专业及13个专业方向，涵盖医、理、文、工、管、法等多个学科门类。现有全日制在校生14165人，其中博士研究生217人，硕士研究生1118人，七年制学生1155人，本科生7729人，专科生3554人，留学生392人。
学校设有中医学、中药学、中西医结合3个博士后科研流动站，是国家首批第二类特色专业（中医学)建设点和国家第一类特色专业(中药学、药物制剂和针灸推拿学)建设点。中药类人才培养模式创新实验区为教育部首批人才培养模式创新实验区www.med126.com，中医临床人才培养模式创新试验区为黑龙江省人才培养模式创新试验区。有国家级重点学科4个、国家中医药管理局重点学科9个、省级重点学科18个；有国家级精品课程8门，省级精品课程20门，校级精品课程52门。学校为国务院学位委员会批准的临床医学博士、硕士专业学位教育试点院校，国家药品临床研究基地，“长江学者奖励计划”设置特聘教授岗位的高等院校之一。学校教学实验中心首批确定为国家级实验教学示范中心。“十五”以来，获国家教学成果一等奖1项、二等奖5项、省级教学成果奖33项。学校获全国首届优秀高等教育研究机构称号。
学校现有省部共建教育部重点实验室1个，国家中医药管理局重点研究室3个，国家中医药管理局三级实验室10个，省重点实验室3个，省普通高等学校重点实验室4个，黑龙江省校企合作工程技术中心1个，科技部中医药国际科技合作基地1个，黑龙江省中医药国际科技合作基地1个，黑龙江省科技创新平台1个。“十五”以来，获得各级各类科研课题立项1598项，其中国家“973”项目3项、“863”项目1项；获得各级各类奖励412项，其中国家技术发明二等奖1项、国家科技进步二等奖6项、高校科学技术自然科学奖一等奖1项、中华中医药科技进步一等奖2项、黑龙江省自然科学一等奖2项、黑龙江省科技进步一等奖3项。在中药血清药物化学研究、中药天然药物药效物质基础研究方面处于国际先进水平，在方剂配伍规律、针灸作用机理研究和中医药治疗内科、妇科、肾病等重大疾病的临床研究方面处于国内领先水平。2008年，学校培养的博士撰写的论文获得教育部、国务院学位委员会“全国优秀博士学位论文”，成为全国第三个获此殊荣的中医药大学。
学校附属第一医院（临床医学院)为国家中医临床研究基地建设单位、国家三级甲等医院、全国示范中医医院。学校附属第二医院（针灸推拿学院)是我省首家获得国家药物临床试验机构认定的中医院，为全国首批现代化中医院建设单位。两附院有国家级医疗中心和重点专科5个、省级医疗中心和重点专科6个。
