基础学院的前身是基础医学部，成立于1958年，2004年7月更名为基础学院。基础学院下设4个系、14个教研室、4个实验中心。承担全校临床医学、医学检验学、医学影像等各专业本科生及研究生的公共课、公共基础课及专业基础课的教学工作。负责生物技术系、生物医学工程系、信息管理系和生物科学系的教学及管理工作。
  我院现有在编教工215人，其中专任教师165人，教授19人，副教授58人，讲师80人，助教8人；博士学位74人，硕士学位80人；博士生导师8人www.med126.com，硕士生导师30人。广东省“千百十工程”培养对象26人，其中省级培养对象2人，校级培养对象24人；全国优秀教师1人；广州市教学名师2人；广州市高校教学团队1个；获政府特殊津贴1人。
  我院明确教育教学改革目标，紧跟国内一流医学院校改革步伐，在质量工程与课程建设、新专业与实验室建设等方面进行了全方位的改革，取得了较好的成效。现有省级实验教学示范中心1个；省级精品课程3门；市级精品课程8门，市级双语教学示范课程3门。近年来教师积极参与编写出版教材，其中主编出版教材25部，参编出版教材47部；教师发表教学论文近200篇；承担省部级教改课题9项，市级项目5项；获全国多媒体课件大赛奖等13项。
  积极探讨国际化办学新模式，生物技术与英国爱丁堡大学签订了2+2办学模式的协议，并已选派优秀学生到爱丁堡大学学习，生物医学工程专业则选派优秀学生到台湾义守大学交流学习；大力储备具有良好英语能力的优质教师，招收留学生，并顺利地开展留学生全英文医学专业课教学，使我院的办学水平显著增强。
在学科建设与科学研究方面www.med126.com，积极落实学校学科强校的发展战略。我院现有基础医学一级学科等6个硕士点。近年来，基础学院承担国家863重大攻关项目及国家自然科学基金项目31项，省部级科研项目32项，市厅级科研项目79项，总科研经费1700多万元。获教育部自然科学奖等各种教改和科研成果奖10项。获发明专利授权三项。在国内外杂志上发表论文年均约150篇，其中SCI收录论文逐年增加。