医药经济学院的办学指导思想：以学科建设为龙头，依托广东经济社会的发展，尤其是医药产业发展，为广东及华南地区培养高素质应用型的经济类专门人才。    
   院精心打造自己的特色学科和特色专业，已经形成了具有鲜明医药特色的经济学科，拥有医药经济学硕士点和国际经济与贸易、保险、经济学3个本科专业。从学科、专业方面的交叉融合来看，我院在学校的学科建设中占有重要的地位。我院是中国国际贸易学会的理事单位。国际经济与贸易专业是校级特色专业和校级重点建设专业。同时，我院国际经济与贸易是学校的双学位和辅修专业。
    我院现有教职工30多人，包括教授、副教授和博士，具有博士、硕士学位教师达94%。近年来，我院老师主持广东省哲学社会科学规划办项目、广东省软科学项目、广东省自然科学基金项目等多项省部级项目，广东省劳动和社会保障厅、广东省教育厅等厅局级项目多项，企业横向项目1项，出版专著、教材十多部。
     我院既重视“厚基础、宽平台”的专业教学，又注重多学科知识的融合，即专业知识和能力与医学、药学知识相结合，旨在培养既精通经济学科与专业又懂医学和药学知识的复合应用型人才。学院非常重视实验、实践等专业技能的培养，同时也非常注重提高学生的综合素质www.med126.com，鼓励并支持学生参加各种赛事，已有多人次获得国家和省级大赛的奖项。如我院组建的SIFE团队，在2011年11月SIFE国际大学生企业家联盟创新公益大赛全国总决赛中，获得了全国赛二等奖。创业教育也是我院的特色之一，单独设置了创业教育中心。
    我院独立拥有二个实验室，分别是综合实验室和模拟法庭。拥有ERP模拟教学系统、Sim Trade 外贸模拟教学系统、金融模拟教学软件、博星卓越系列教学软件等教学实验软件，投资达200多万元，满足了复合型、应用型人才培养的需要。