黑龙江中医药大学基础医学院前身为黑龙江中医学院基础医学部，始创于1972年4月, 1997年7月更名为基础医学院。学院由中医基础系列、西医基础系列、外语系列、体育部四大部分组成，并于2009年创建黑龙江中医药大学国医堂。现有下属教研室24个，拥有国家级重点学科1个、国家中医药管理局重点学科2个、省级重点学科5个，国家中医药管理局三级重点实室2个，国家中医药管理局重点研究室1个，国家中医药管理局名老中医工作室1个，省级A类重点实验室1个医学全在线,搜集整,理www.med126.com，具有博士学位授予权学科5个、硕士学位授予权学科7个，国家级精品课3门、省级精品课9门、校级精品课16门。学院现有教职工153人，其中教授32人，副教授42人，党员73人。博士生导师17人，硕士生导师30人另有客座教授10人。
基础医学院承担着全校各专业、各层次中西医基础课、共同课、体育课等必修及限选课程的教学任务，为我校医学生日后的深造打下了坚实的基础。多年来，学院教师共获得国家级教学成果一等奖1项、二等奖4项，省级优秀教学成果一等奖5项，省高教学会教学成果奖59项，校级教学成果奖35项，国家霍英东教育基金（教学类)三等奖4项医学全在线www.med126.com。我院任全国统编教材和新世纪规划教材主编6部、主审3部、副主编10部、编委20部，主编、主审全国统编教材和新世纪规划教材教学参考书4部、案例式教材1部。国家、省、校级学科多数都已经形成了稳定而有特色的研究方向，1996年以来，中标科研课题累计500余项，科研经费800余万元,荣获国家、省、厅局级科研成果奖120余项。
近年来，学院各项工作突出，荣获国家级教学名师2人，全国先进工作者称号1人，全国优秀教师5人、全国教书育人先进个人1名，首届中医药传承特别贡献奖1人，中国百名杰出青年中医2人，“新世纪百千万人才工程”国家级人选1人，全国师德先进个人1名，国务院政府特殊津贴7人，霍英东基金会高校青年教师1人，全国教育系统先进集体1个。黑龙江省模范教师5人医学全在线www.med126.com，黑龙江省优秀教师2人，黑龙江省教育系统教书育人先进个人1人，黑龙江省名中医7人，黑龙江省劳动模范5人。以及黑龙江十大杰出青年、黑龙江省卫生系统跨世纪拔尖人才、黑龙江省“五四奖章”、黑龙江省青年科技奖、哈尔滨十大杰出青年、哈尔滨市青年科技奖等校级以上表彰及奖励70余人次。学院连续多年被学校评为为文明单位标兵，荣获黑龙江省教育系统先进集体和哈尔滨市“三育人”先进集体等多项荣誉。
