基础医学院前身是原国立贵阳医学院医本科，1938年随贵阳医学院的建立而诞生，1982年组建成基础医学部，2003年更名为基础医学院。70余年来在历届学校（院、系)领导、专家、教授的带领下，经过全院教职员工共同努力，基础医学院发展壮大成为具有一定规模，集教学、科研、社会服务为一体，以培养医学人才为主体的重要教学单位，每年承担学校近43 %的教学任务。目前基础医学院下设4个行政科室，15个教研室，5个实验室和3个实验中心，有1个博士后科研流动站（基础医学)医学全在,线www.med126.com，1个博士授予点（病理与病理生理学方向)，7个硕士学位授予点，1个基础医学本科专业（医学生物技术方向)，4个省级重点学科，7门省级精品课程。
基础医学院的建设和发展得到各级政府和学校领导长期的关心和支持，全国人大副委员长韩启德院士、北京大学校长周其凤院士，省、市及学校党政各级领导多次到我院视察和指导工作。
4个省级重点学科：病理学与病理生理学、病原生物学、人体解剖与组织胚胎学、生物化学与分子生物学
1个博士学位授予点：病理学与病理生理学
7个硕士学位授予点：细胞生物学、生化与分子生物学、人体解剖与组织胚胎学、免疫学、病原生物学、病理学与病理生理学、药理学
近5年来，基础医学院获国家自然科学基金科研项目15项，973子课题1项，教育部重点科研项目1项，教育部“春晖计划”科研合作项目2项，教育部高等学校博士学科点专项基金2项，贵州省优秀人才省长基金项目、贵州省优秀青年人才项目、贵州省委组织部特助经费、贵州省科技攻关项目医学全在,线www.med126.com、贵州省科技基金、贵州省国际合作项目、贵州省教育厅基金、贵州省卫生厅基金等项目143项，市、院级科研项目55项，合计资助金额达1400万余元。国内外公开发表论文近600篇，其中核心期刊327余篇，SCI收录29篇，主编教材8部，参编教材27部。
近年来与美国、法国、瑞典、丹麦、比利时、日本、荷兰等国家和地区的科研院所建立并保持着良好的交流和合作关系。进行了多方向、多层次的学术交流。近年来基础医学院加强了对外合作交流，先后参加国际国内学术会议约300人次，有20余人出国学习、交流和攻读学位。
国际合作单位：
美国加州大州圣地亚哥分校生物工程系；卡罗琳斯卡大学；香港大学；哈佛大学；日本千叶大学。
国内合作单位：
北京大学医学部；中山医科大学；四川大学。
