研究生学院现设有教学培养科、学科建设科、学生管理科、中心实验室、综合办公室四个科室，党总支书记和院长各1名、副主任1名、教学和学生管理、中心实验室管理人员等工作人员9名，教授3人，副教授3人，中级职称4人。
研究生部自2002年成立以来，通过不断加强学科和导师队伍的建设，进一步改善办学条件与科学研究环境，使我校的研究生教育工作有了长足的进步。自2000年开始至今，我校二级硕士学位授予权学科已由1个增至12个，2010年又新增生物学医.学全.在.线网站www.med126.com、临床医学和公共卫生与预防医学三个一级硕士学位授予权学科，新增临床医学硕士和公共卫生硕士两种专业学位，现有硕士生导师170多人，目前在校研究生370人。2006年获得同等学力人员申请硕士学位授予权，并开办了六期研究生课程进修班。
自2005年学院将学科建设工作由研究生学院管理以来，我们积极开展学位点与学科建设各项工作，取得了良好的成效。2005年确定了19个院级重点学科、22个院级重点建设学科。2008年积极组织各院系申报自治区重点学科，经内蒙古自治区教育厅审核批准，我院新增3个学科自治区重点学科，2个自治区重点培育学科。我院现有自治区教育系统重点学科4个：生物化学与分子生物学、人体解剖与组织胚胎学、内科学（心血管病)、内科学（风湿病)；自治区教育系统重点培育学科2个：生理学、药理学；2009年自治区卫生厅重新确定和评审领先学科、重点学科及重点实验室，我校的肾内科、消化内科被确定为领先学科；神经外科学、风湿与自体免疫病学、急诊急救医学被评为重点学科；医学分子生物学实验室、人体解剖学实验室、营养与食品卫生学实验室被评为重点实验室。
