川北医学院药学专业是经国家教育部2011审批同意招生的新专业。该专业以学院近60年医学院校的办学积淀所形成的较为完善相关学科为基础，在两届临床药学分流方向的办学过程中的经验与专业人才储备之上，紧密依托我院已有的药理教研室、附属医院药剂科、化学教研室、药物研究所等专业科室进行建设。其中药理学为硕士学位研究生招生和四川省卫生厅重点学科。药物研究所为2010年中央财政支持地方高校项目“临床药学创新实验基地” 建设单位，已拥有药物化学实验室、药物分析实验室、药物制剂实验室、微生物实验室、药理学实验室等专业科研实验室。该专业已拥有专业教师队伍近30人，其中副教授（或相当职称)以上12人，博士学位人员4人，留学归国人员3人www.med126.com。作为新办专业，在学院领导、各职能部门及其他院系的大力支持下，将在管理体制、资金投入、人才引进、实验室建设、学科建设、科学研究、实习（训)基地建设、学生就业等方面加大力度，充分利用我院已有的优势，明确办学思想，突出办学特色，实现超常规发展。
在学校各级领导关心和大力支持下，药学院2011年招收并报到注册首届药学专业学生57人，主要培养方向倾向于临床药学。主要开设了药学导论、英语、高等数学、生物学、无机化学、有机化学、分析化学、生物化学、解剖学和生理学、微生物与免疫学、临床医学概论等基础课程，以及药用植物学、药理学、药物化学、生药学、天然药物化学、药剂学、药物分析、生物药剂学与药代动力学、药事管理学和临床药物治疗学等专业课程，并在学生毕业实习阶段设置综合实验和企业、医院药房实习等环节，重点培养学生运用新药研发、药物应用等方面实际工作能力。本专业学生毕业后主要在各级药监局、卫生局和医院从事各种临床药学服务、临床药学研究以及药品生产企业从事药品的生产、研发和市场营销等工作。
药学院不断拓展对外合作交流，目前，学院已和川东北地区多家药企，如顺生制药、南充药业集团中药材公司等初步达成了新药开发、药学学生实习就业、资源共享等合作意向，并在2012年3月与美国托莱多大学药学院就本科生及研究生交流、教师交流与培训等方面达成了一定共识。
