生命科学和医学被认为是当今世界科学技术领域最活跃、最有希望取得关键性突破的学科之一，为此，清华大学决定创建医学院，这是清华为顺应国家发展需要及世界高等教育和科学技术发展的趋势，为向世界一流大学的目标奋进迈出的极为重要的一步。
清华大学医学院成立于2001年10月25日，院长由我国著名医学科学家、两院院士吴阶平教授担任，首任常务副院长为赵南明教授，现任常务副院长为“千人计划”教授施一公。
医学院目前下设3个系1个中心- 基础医学系、生物医学工程系、药学系和公共健康研究中心，建立了基础医学、临床医学、药学、生物医学工程和公共健康五大学科，发展成为优秀学生培养、尖端科学研究和专业社会服务的综合基地。
依托清华大学作为综合性大学的整体优势，医学院致力于培养具备人文社会科学、自然科学、基础医学及临床医学等相关基础理论知识，既掌握临床技能又具备科学研究能力，能在医学领域从事研究、医疗服务、教学及管理的医学科学家、高级临床医生医学.全在.,线提,供www.med126.com、医学教育工作者和医学高级管理人才。从2009年开始招收清华大学“医学药学实验班”，其中医学生学制8年，学生完成学业，成绩优良者将获得医学博士学位( M.D.)；药学培养学制8年，学生完成学业，成绩优良者将获得博士学位（Ph.D.)。2013年起更名为“医学实验班”和“药学实验班”。
生物医学工程系充分发挥清华大学工科优势，推进工程技术与医学的紧密结合，2007年被教育部评为一级学科重点学科，《医学图像》、《数字信号处理》等课程建成清华大学首批精品课。
医学院的两个一级学科生物学、生物医学工程在教育部2012年学科评估中取得可喜成绩，双双实现历史性的突破：清华大学生物学科首次名列全国第一，清华大学生物医学工程学科在往年评估排名的基础上有大幅度提高，首次名列全国第二。
为了实现师资队伍规模和教学质量的稳步提升，医学院实行了Tenure-track流动制为核心的人事制度改革，目前已拥有一支学术精湛、素质过硬、高度合作的专业化研究队伍和一批业务精良的学科带头人。这些人既有国内成长起来的专家教授，更对的则是来自于欧美一流的学术研究/教学机构和世界知名的生物医药企业。医学院现有教师101人，其中中国科学院院士1人，中国工程院院士1人，千人计划教授11人，青年千人引进8人，长江学者10人，国家杰出青年基金获得者6人，校百人计划引进人才4人。2012年4月受聘医学院客座教授的Brian Kobilka更是荣获了2012年的诺贝尔化学奖。
在当今工科与医学和生命科学急速融合的国际化大趋势下，清华大学于2004年1 月成立“清华大学生命科学与医学研究院 ”。其主要职能是将分散于全校各院系的有关生命科学、医学及相关的工程学科统一组织和协调起来，建立若干研究所(或研究平台)，以利于大跨度的学科交叉和取得重大科技成果。此后，陆续成立生物芯片国家工程中心、血管医学研究所医学,全 在线.提 供www.med126.com、脑神经疾病研究所、医学系统生物学研究中心、清华大学艾滋病综合研究中心、清华－约翰霍普金斯大学生物医学工程联合研究中心、清华大学（医学院)－拜耳创新药物联合研究中心、清华大学-哥伦比亚大学高等基因组技术联合研究中心、清华大学生物医学影像研究中心、清华大学临床神经科学研究院、干细胞与再生医学研究中心、清华大学（医学院)－比利时杨森制药有限公司传染病联合研究中心、清华大学长庚医学发展研究院、清华大学（医学院)－中国人民解放军海军总医院海洋医学与救援联合研究中心、清华大学－信立泰小分子药物联合研发中心等专业研究机构。
2004年4月，原信息产业部401和402医院更名为清华大学第一和第二附属医院。我校还正在积极建设一所高水平综合性的新附属医院－－北京清华医院。
我校于2005年9月与解放军总医院(301医院)签订合作协议，商定301医院成为清华大学临床教学医院，第一批聘请22位知名专家作为清华大学的兼职教授，并在科学研究领域开展广泛合作。2010年3月我校与北京积水潭医院合作成立“清华大学积水潭骨科学院”，开展骨科医师专业培养，北京积水潭医院同时也成为清华大学临床教学医院。
面向清华新的百年，医学学科的快速发展必将为学校建设世界一流大学的宏伟目标做出重要的贡献！
