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《第三军医大学学报》创刊于1979年，国内外公开发行。主要报道医药领域的新理论、新经验、新技术和新方法。
《第三军医大学学报》栏目设有：专家论坛、基础医学、临床医学、军事医学、预防医学、高原医学、综述、科研简报、技术方法、经验交流和个案与短篇报道。
《第三军医大学学报》主要读者对象：为医药学领域的中高级科研、医疗人员和高等医药院校的师生。
《第三军医大学学报》曾获得第二、三届国家期刊奖百种重点期刊，是中国综合性医药卫生类核心期刊、中国科技论文统计源期刊、中国科学引文数据库统计源期刊。被国内所有数据库和文摘杂志以及美国《化学文摘》（CA)、俄罗斯《文摘杂志》（Pж)作为源期刊收录。是中国被引频次最高的500种科技期刊。
《第三军医大学学报》收录情况：
CA 化学文摘(美)(2014)
JST 日本科学技术振兴机构数据库(日)(2013)
Pж(AJ) 文摘杂志(俄)(2014)
CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(2015-2016年度)(含扩展版)
北京大学《中文核心期刊要目总览》来源期刊： 1992年(第一版), 1996年(第二版), 2000年版, 2004年版, 2008年版, 2011年版, 2014年版
