第一、修改主要内容是论文修改的首要问题。
主要是审核分析论文的内容是否准确地反映客观事物的规律性，以及主题的鲜明性，论点的正确性，论证的合理性，概念的清晰性，数据的可靠性，统计的科学性等。
第二、论文的主题和论点这是论文撰写全局性的问题。
因此，论文修改应从其主题和论点着手，审核分析其主题思想是否明确，立意是否新颖，论点是否正确集中，以及分论点与总论点的一致性，论点和结果的一致性。
第三、论文的论据包括医学研究和临床实践直接观察的结果和引证的文献资料两方面。
这是论文撰写的关键性问题，因为观察结果中数据的真实性、准确性是极其重要的。因此，必须认真分析复核设计是否严密，样本的代表性和可比性，数据是否真实，统计学方法是否规范科学，以及引证文献中援引资料的可靠性和合理性。
第四、论文的论证主要是论文的“讨论”部分。
看其是否能恰当地运用论据组织论证其论点，是否能紧密结合实验及观察结果进行讨论，特别应注意杜绝旁征博引、离题发挥。审核分析论证中是否存在逻辑。
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