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在正常情况下，动物消化道内就存在大肠杆菌，死后也易侵入组织，故从动物组织、尤其肠内容物中分离出该菌，不能作为确诊本病的依据，必要时还需进行鉴定其血清型。本病肠炎型要与犊牛沙门氏菌病、犊牛球虫病、犊牛轮状病毒病相鉴别；败血型要与犊牛双球菌性败血症鉴别。
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注意要与犊牛沙门氏菌病、犊牛球虫病、犊牛轮状病毒病相鉴别
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犊牛沙门氏菌，球虫病等相鉴别