八、光敏2,4-二硝基苯(光敏DNP)标记DNA法
光敏DNP由一连接臂组成,一端是2,4-二硝基苯,另一端有芳基叠氮化合物。此法适用于含氨基检测基团。其敏感性和光敏生物素标记探针相同,检测时需要抗DNP抗体和免疫化学显色。标记方法:(1)DNA不心变性,必须溶于水中,取2~10μg10μl,加入二甲亚砜25μl,每微克DNA加入光敏DNp 2μg(在避光条件下),混匀。(2)置入冰浴中,在特制灯10cm下照射10min。(3)加入水165μl,4mol/L醋酸钠20μl和异丙醇50μl,混匀。(4)用705和无水乙醇沉淀各一次,晾干,按50μg/ml溶于200μl水中,如探针不溶时,可在60℃水溶中加热10min,离心5min,除去不溶性杂质,分装,-20℃可保存1~2年。此法简便,不仅适用于核酸标记,也适用于蛋白质标记。
九、三硝基苯磺酸(TNBS)标记核酸探针
在温和的条件下,TNBS将核酸的胞嘧啶转化为N-甲氧基-5,6-二氢嘧啶-6-磺酸盐衍生物,对胞嘧啶残基进行磺化修饰制成磺化半抗原探针。此法十分简便,也可用于蛋白质的标记。标记方法:取变性单链的DNA5μg,溶于0.02mol/L硼酸钠缓冲液(pH8.6)中,加入TNBS5μg溶解,在室温中反应1h。移入冰浴中,加入无水乙醇和70%乙醇各洗1次,晾干,用50μl消毒双蒸水溶解,分装,-20℃保存备用。
十、生物素化的RNA探针标记
RNA探针比cDNA探针的敏感性提高10倍以上,在许多优点。它们是单链,不需变性,也没有互补链的干扰,与靶基因杂交比DNA探针更稳定。Bio-11-dUTP可通过Sp6、T3和T7RNA聚合酶掺入到RNA转录子中。标记方法:其下列反应体积为50μl:40mmol/l Tris HCl pH8.0、8mmol/l MgCl2、2mmol/L亚精胺、25mmol/l NaCl, 1mmol/L每一ATP、GTP、GTP,1mmol/L生物素Bio-11-Dutp,500ng模板,45u T3RNA聚合酶。混合,37℃反应1h。加入10%SDS终止反应。凝胶过滤分离标记RNA探针。
十一、辣根过氧化物酶标记核酸探针法
此法标记原理如下图所示:
标记的HRP部分催化底物化学发光反应:氨基苯二甲酰肼 氨基苯二甲酸
+N2+光→X-光片上感光10~20min显定影。
光亮子在酚、萘及胺类等增强剂促进下,而使光亮增强。
这种方法就是利用特殊的酶底物,氧化后把产生的能量转变为光能放出,称为化学发光。杂交后与探针结合的酶催化相应的发光剂,经增强剂将光能放大,在X光片上显示杂交信号。此方法灵敏度与同位素标记水平相当,简便快速,安全,是一种特异性好的检测手段,具有广泛的应用前景。
HBV-DNA的HRP标记方法:质粒中插入HBV全基因组DNA,长3.2kb,载体为PBR322质粒,4.3kb。将质粒DNA用三蒸水稀释成10ng/μl,取20μl放入EP管,100℃变性5min,加入20u HRP标记试剂,混匀,加入戊二醛20μl混匀,37℃10min,此时可立即使用,或放在冰浴中10~15min内使用,或加入50%去离子甘油-20℃保存供分子杂交用,可存放6个月。
十二、用聚合酶链反应标记高活性DNA探针
聚合酶链反应(PCR)或称体外基因倍增技术,它利用一对位于待扩增的DNA序列两端的取向相对的DNA引物,在DNA聚合酶的介导下,经过多次变性,退火和延伸过程的重复性循环,大量合成靶DNA序列。在标记dNTP存在时,经PCR反应产生的靶DNA片段均参入了标记物,用此法标记的探针标记率高达97.4%。此法重复性好,简便、快速、特异、不要求模板DNA的纯度,可以大量制备。此法有普遍应用价值。
标记方法如下:待标DNA模板1ng,50mmol/L KCl, 10mmol/L Tris-HCl(pH8.4),2.5mmol/L MgCl2 dATP、dCTP、dGTP各200μmol/l dTTP150μmol/Ll,Bio-11-dUTP 50μmol./L, 引物各1μmol/L,明胶200μg/ml,2u Taq DAN聚合酶,总反应体积为100μl。混匀后,加石蜡油封顶,94℃和55℃各2min,72℃3min,经25个循环后,可产生5~10μg标记探针,需时仅4h。乙醇沉淀扩增的产物后,溶于100μl TE中,分装-20℃。