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DNA重组实验中常用的技术
来源:医学全在线 更新:2007/12/3 字体:

 

  (二)试剂盒成份

  1.无标记对照DNA1 此管内有20μl pBR328 DNA100μg/ml,pBR328分别用BamHⅠ,BglⅠt HinfⅠ消化,它们的混合比例为2:3:3,共有16个Pbr328片段,这些片段的大小分别为:4907,2176,1766,1230,1033,653,517,453,298,234,234,220和154×2bp。

  2.无标记对照DNA2 此管内有20μl pBR328 DNA200μg/ml,已用EcoRⅠ线性化。

  3.DNA稀释缓冲液 有两管,每管1ml[成分为:Tris-HCl(10mmol/L),EDTA(1mmol/L),pH8.0(20℃)]内含鲑鱼精DNA(50μg/ml)。

  4.标记对照DNA 此管内有50μl线性化pBR328DNA,按标记方法已标记有地高辛配基dUTP,含20μg模板DNA,每毫升含5μg合成的标记DNA。

  5.六聚核苷酸混合物

  6.标记用混合底物 此管内有50μl 10倍浓度的dNTP标记用混合底物,含dATP(1mmol/L)dCTP(1mmol/L),dGTP(1mmol/L),dTTP(0.65mmol/L)和Dig-dUTP(0.35mmol/L),pH6.5(20℃)。

  7.DNA聚合酶Ⅰ大片段(标记级) 此管内有25μl DNA聚合酶Ⅰ大片段(Klenow),2U/μl。

  8.(Dig)AP结合物 此管内有200μl多克隆羊抗地高辛配基Fab-片段,结合有碱性磷酸酶750U/ml。

  9.NBT 有两管,每管1.25ml,是溶于70%(V/V)二甲基甲酰胺的硝基蓝四唑盐溶液(75mg/ml)。

  10.X-磷酸盐 有两管,每管0.9ml,是溶于二甲基甲酰胺的5-溴-4-氯-3-吲哚磷酸盐的甲苯胺溶液(50mg/ml)。

  11.封阻试剂 有两瓶,每瓶有50g粉剂。

  (三)需配制的溶液

  EDTA(0.2mol/L),pH8.0 (20℃);LiCl(4mol/L);70%(V/V)乙醇;Tris-HCl(10mmol/L);ED-TA(1mmol/L),pH8.0(20℃);10%(V/V)N-十二烷基肌氨酸钠盐;10%(V/V)SDS;20×SSC:3mol/l NaCl;0.3mol/L柠檬酸三钠;pH7.0 Tris-HCl(100mmol/L);NaCl(150mmol/L);pH7.5Tris –HCl(100mmol/L);NaCl(100mmol/L);MgCl2(50mmol/L)pH9.5(20℃)。

  (四)操作方法

  1.标记DNA探针 每次标准的反应可标记10ng至3μg线性的DNA,也可标记更大量的DNA,但所有的成分和体积要相应增加。

  (1)DNA探针热变性,煮沸10min,迅速冷却于冰/乙醇中5min以上,待用。

  (2)取Eppendorf管(1.5ml)置于冰上,加下列及试剂:

  新鲜变性的DNA           1-3μg

  六聚核苷酸混合物         2μl(管5)

  dNTP标记用混合底物        2μl(管6)

  加无菌重蒸水至          19μl

  DNA聚合酶Ⅰ大片段(Klenow)   1μl(管7)

  (3)在37℃保温至少60min,可到20h。

  (4)煮沸5min,终止反应。

  (5)15000rpm离心30s,置于冰上待用。

  2.预杂交 按100cm2膜用20~40ml预杂交溶液,预杂交时使溶液处于流动状态。

  预杂交液组成:5×SSC

  0.5%(W/V)封阻试剂(管11)

  0.1%(W/V)N-十二烷酰肌氨酸钠

  0.02%(W/V)SDS

  膜放入塑料袋,灌入预杂交液,排除气体后密封,在65℃预杂交过夜。

  3.杂交 按100cm2膜用2.5ml杂交液,杂交时偶尔摇动杂交袋,使里面的溶液重新分配。

  杂交液组成: 50%甲酰胺(V/V)

  5%(W/V)封阻试剂

  5×SSC

  0.1(W/V)N-十二烷酰肌氨酸钠

  0.02%(W/V)SDS

  新变性标记DNA(150ng/ml)

  杂交液取代预杂交液,替换间膜不能干,成功地替换应是膜与塑料袋间形成一层杂交液膜。于42℃杂交过夜(16~20h)。

  4.洗膜  按100cm2膜用250ml洗膜液计算。

  (1)在室温下用2×SSC/0.1%(W/V)SDS溶液漂洗,5min,2次。

  (2)在65℃条件下用0.1×SSC/0.1%SDS溶液漂洗,10min,2次。

  (3)在室温下用2×SSC溶液漂洗1次。

  5.免疫测定

  (1)配制溶液

  缓冲液1:Tris-HCl(100mmol/L);NaCl(150mmol/L)pH7.5(20℃)

  缓冲液2:0.5%(W/V)封阻试剂(管11),配制于缓冲液1中(封阻试剂不会快速溶解,因此应预早1h前配制此溶液,将试剂溶于50~70℃,此溶液保持混浊)。

  缓冲液3:Tris-HCI(100mmol/L);NaCI(100mmol/L);MgCI2(500mmol/L)pH9.5(20℃)。

  缓冲液4:Tris-HCl(10mmol/l);EDTA(1mmol/L);pH8.0(20℃)

  显色溶液:新鲜配制,在10ml缓冲液3中,加45μlNBT溶液(管9)和35μlX-磷酸盐缓冲液(管10)。

  2. 显色过程

  A.膜在缓冲液1中短暂洗涤(1min)。

  B.在100ml缓冲2中保温30min。

  C.再用缓冲液1短暂洗涤。

  D.用缓冲液1稀释的抗体结合物(管8)至150U/L(1:5000);稀释后的抗体结合物在4℃只能稳定12h。

  E.膜在20ml稀释的抗体结合物溶液中保温30min。

  F.用100ml缓冲液1洗膜,以除去未结合的抗体结合物,15min,2次。

  G.膜在缓冲液3中平衡2min。

  H.在黑暗条件下,膜与10ml显色溶液放入塑料袋内密封或放入合适的盒子内,几分钟内开始出现颜色,一般显色反应在1天后全部完成。当颜色显影时,不可振荡或搅拌。

  I.当要求的点或带已被检测时,可用50ml缓冲液4洗膜5min终止反应。

  J.摄相。

  说明:上述各反应均在室温下进行,除了显色反应外,均需振荡或搅拌。

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