颅内动脉的先天性囊状动脉瘤，特别在Willis环，可单独发生，或伴其他先天性异常(如主动脉缩窄或多囊肾)。它们是颅内蛛网膜下腔出血的重要原因。

颅内动脉真菌性动脉瘤为感染性心内膜炎特别险恶的并发症，常导致颅内出血。通过强有力的抗生素治疗后，感染可以清除，但通常仍需切除。