临床医学主要依托于海南医学院附属医院。附属医院是三级甲等综合医院，编制床位1500张，设临床科室44个，职工1867人，其中专任教师549人，正高116人，副高239人，博士43人，硕士200人。医院年门诊量约90万人次，住院病人约2.7万人次，年住院手术9039台。拥有直线加速器、64层螺旋CT、1.5T磁共振、数字减影X线机、超速分选型流式细胞仪等高水平的临床医疗和科研设备，设备总值约3.2亿元。
1977年开设临床医学本科专业，目前是海南省住院医师规范化培训基地。特色：
临床医学以科研、技术开发和临床应用一体化为特色：生殖医学中心在国内较早开展体外受精-胚胎移植技术，建立了较为完善的人类辅助生殖医学体系，并作为骨干参与了卫生部人类辅助生殖技术法规和技术标准的制定；在肿瘤发病机制研究中医学,全 在线.提 供www.med126.com，首次克隆调节蛋白SNX25，系统研究其在肿瘤干细胞形成中的作用，为相关肿瘤防治寻找新方向；在以表面置换珊瑚羟基磷灰石为支架构建组织工程骨的实验和临床研究等方面，逐步形成了特色与优势。并在急救医学的宏观管理、学科建设、院前急救及创伤医学领域形成了新的亮点。受科技部委托，主办了“东南亚及非洲地区重大疾病的防治与诊疗技术培训班”，具备一定的国际影响力。
优势：
学科与队伍：临床医学拥有专任教师315人，高职比62.9%，硕博比50.2%，其中国务院特贴专家和省荣誉专家12人，兼职博士生导师2人、硕士生导师25人。拥有国家级、省级和厅级重点学科分别为1个、2个和3个；省卫生厅重点扶持/特色专科3个；7个临床专业获批药物临床试验资格。
科研能力：5年来新获科研项目295项，其中国家自然科学基金27项，“973”子项目1项，科研项目经费（不含配套)共计2105.3万元。5年来共有650人次参加国内外学术会议，邀请59名国内外学者前来我院做学术报告，促进了教师队伍素质的提高。
科研水平：5年来，发表论文970篇，其中SCI收录论文59篇，获得省级科研成果13项，其中一等奖3项，二等奖4项。
人才培养：临床医学专业本科教育2010年被教育部授予“高等学校特色专业建设点”。临床技能中心被授予“国家级实验教学示范中心建设单位”。临床医学专业本科生2011年参加第二届全国高等医学院校大学生临床技能竞赛荣获总决赛二等奖，华南分赛区第一名。5年来先后与郑州大学、广西医科大学等高校合作联合培养硕士研究生，共招生52人，34人获得硕士学位。
