《和剂局方》既载有藿香正气散，也载有平胃散与二陈汤。平胃散、二陈汤之组成、结构非常严谨。藿香正气散是在上述两方相合之基础上，又加了五味中药，并去苍术、乌梅加土炒白术而成。按照由简而繁之发展规律来看，上述3方，应该是先有平胃散、二陈汤，然后才有藿香正气散。兹浅析如下。
　　平胃散：由苍术12g，厚朴、陈皮、生姜各9g，甘草3g，大枣4枚组成。方中苍术苦温，能迅速除湿，湿去则脾气自然健运，故为方中之君药；厚朴苦温辛燥，擅长除湿消胀，故与苍术相伍，则能燥湿理气，并令脾气不失其司，故为方中之臣药；陈皮苦辛温，以其能理气和胃，化痰祛湿，故可助脾胃之运纳，因此，应为使药。所以又用姜、枣者，以增强调和脾胃之功效也。诸药合之，故具有除湿散满，调和脾胃之功效，并为一治疗中焦湿阻之良方。基于上述，故本方可用来治疗脘腹胀满、不思饮食、口淡无味、恶心呕吐、大便稀溏、肢体倦怠、苔白腻、脉濡缓等。
　　二陈汤：由陈皮、半夏、茯苓各12g，甘草3g，生姜、乌梅各9g组成。方中半夏辛温燥湿化痰，和中止呕；陈皮理气化痰；茯苓健脾渗湿，生姜降胃气，除痰湿，乌梅敛痰生津，并防止药燥伤津液；甘草调中补土，故上药合之，为燥湿化痰之佳剂。基于上述，所以此方可用来治疗湿盛痰凝引起的胸膈胀满、恶心呕吐、咳嗽痰多、易于咯出及头晕心悸、苔白厚、脉滑等。
　　藿香正气散：在上两方之基础上，去掉苍术、乌梅，加土炒白术、藿香、紫苏、桔梗、白芷、大腹皮各9g，即为藿香正气散。方中藿香芳香辛温理气，以宣通内外之气机，化湿和中，以止呕止泻，消胀止痛；土炒白术健脾除湿；紫苏、白芷、桔梗以解在外之邪，开肺气以通调水湿；陈皮、厚朴、大腹皮以燥湿健脾，消胀除满，；又用二陈汤去乌梅者，行气燥湿，化痰止呕也。故上药合之，则可共奏解表和中，理气化湿之功效。基于上述，故临床上藿香正气散多用来治疗下述诸种病症。
　　外感风寒，发热恶寒，头身作痛，无汗，鼻塞清涕，或外感风湿，头重如裹，一身酸痛而沉，转侧不利，又内挟中焦湿滞而脘腹胀闷，恶心呕吐，肠鸣腹泻，苔白腻，脉浮滑或浮濡数者，应发散风寒与风湿，化湿浊，畅气机，和脾胃。用藿香正气散治之，均可取得满意之效。
　　初到异地，不久即感不适，或头昏而闷，饮食纳少，欲吐不吐，厌油，或腹胀腹痛，大便稀溏，日1～2次，苔均白滑或白厚，脉缓濡或滑，且数日不解者，为水土不服也。缘由湿浊中阻，升降失司使然。当和中化湿，宣展气机。用藿香正气散去白术、紫苏、大腹皮加苏梗、苍术、草蔻、佩兰各9g，数剂即效。
　　人在高山丛林之中，感受山岗瘴气而突然发生头部胀闷，腹痛，或吐或泻，苔白滑，脉沉濡，或在秽浊不堪的环境之中，骤然出现头面发青，昏不知人，手足厥冷，皆湿浊使然也。前者宜用藿香正气散化湿和中，交通上下，后者宜先用开窍之药，待病人清醒后，再用藿香正气散宣通内外，芳香化湿，则皆可收到速效。
　　疟发之时，一身尽疼，手足沉重，寒多热少，苔白滑或腻，脉弦缓或濡者，湿疟也。因感山岗瘅气而证见时寒时热，一身沉重，苔白滑，脉弦滑者，瘅疟也。其治均宜化湿截疟。用藿香正气散去紫苏、大腹皮加柴胡18g，黄芩12g治之，必获著效。
　　卒然脘腹胀痛，上吐下泻，谓之湿霍乱；腹中绞痛，欲吐不吐，欲泻不泻，谓之干霍乱。若吐利腥秽，上下所出之水澄彻清冷，四肢厥冷，不喜饮水，苔白滑，脉沉而迟者，为寒湿所致之霍乱也。前者应先用盐水探吐，吐后即用藿香正气散调理之；后者应祛寒化湿，用藿香正气去紫苏、白芷、大腹皮，加肉桂、吴茱萸各9g治之，甚验。
　　暑湿犯及肌肤、胃腑，证见发热，微寒风寒，呕吐纳呆，脘腹作胀，身重肢困，口中甜腻，或大便稀溏，苔白滑者，暑轻湿重也。其治应化湿为主，祛暑为辅。用藿香正气散原方或加香薷、扁豆治之，其效颇佳。
　　寒湿犯及中焦致泻下清稀，甚则如水样，肠鸣，时而腹痛，自觉腹中有冷感，苔白舌质淡，无论是否兼有外感风寒之证，用藿香正气散治之，皆可获得捷效。
　　下白痢而又带有稀黄，或纯泻清稀之便，腹痛或不痛，胸膈胀闷，食少嗳气，苔腻色白，脉濡缓或濡弱者，寒湿所致之泻痢也。用藿香正气散芳香化湿，健脾除湿，温燥寒湿，宣肺利膈，则必收良好之效。
　　有的人一乘车船，即发生头昏胀闷，恶心呕吐，且用诸药预防，效果均不理想。若改用藿香正气散，在上车船前半小时服，或发作时服，可收到明显之效。
　　总之，藿香正气散为化湿除痰、消饮疏表之剂。现多用来治疗胃肠感冒、夏季感冒、流行性感冒。随证化裁，还可用来治疗急慢性胃炎、急慢性肠炎、胃及十二指肠溃疡、胆囊炎、胰腺炎、妊娠恶阻而证属湿浊阻滞中焦者，效果也非常好。