在生药资源学方面，2006年，中国医药质量管理协会GAP工作委员会落户本方向，2009年由本方向科研人员主导的温州道地药材温莪术GAP基地建设通过国家药监局现场验收，为生药学方向的科研、教学和产业发展提供了一个强有力的平台。
近5年主编出版了《中药材GAP系列丛书》、《黄精》、《天然药物温莪术》等生药学专著，参编了《国家药典-临床用药须知》等，发表论文45篇，承担了国家自然科学基金、973、国家新药创制重大专项、浙江省重大科技专项等多项省部以上级科研项目，科研经费充足。
方向四：药物分析学：
本方向组建了蛋白质染色技术、电化学和代谢组学（拥有600MHz核磁共振波谱仪)药物分析平台，结合药物本身的性质，进行结构分析和定性定量分析等多种研究。本方向的蛋白质染色技术分析平台拥有较强的实力和基础，带头人金利泰教授医,学全,在线.搜集.整理www.med126.com，浙江省千人计划入选者、浙江省医药卫生高层次人才、浙江省高校中青年学科带头人，是《ELECTROPHORESIS》（IF：4.101)、《PROTEOMICS》（IF：6.088)杂志审稿人，在《ELECTROPHORESIS》等期刊上发表了10余篇论文，其中1篇为第一作者的特邀综述，目前承担着相关的863计划和国家自然科学基金项目，进展良好。
目前，本方向拥有六名高级职称教师，拥有浙江省千人计划、浙江省优秀博士后、浙江省医药卫生高层次人才等，初步形成了一支结构合理、层次较高的人才梯队。目前，形成了蛋白质染色技术（蛋白质组学)、电化学分析、代谢组学、现代仪器分析等稳定的研究方向。承担了863计划、国家自然科学基金、浙江省重大科技专项等科研项目，总经费500余万元。在《ELECTROPHORESIS》、《PROTEOMICS》等SCI期刊上发表论文23篇。
现阶段的主要研究方向如下:
1.化学药物和生物技术药物的定性和定量分析，药物质量标准的制定。
2.药物分析中的新技术和新方法，及其在药学和生物医学中的应用。
3.体内药物分析。
4.中药分析和新药开发研究。
方向五：微生物与生化药学：
本方向主要研究内容包括基因工程药物的上游构建、中试、发酵、纯化、突变与改构、化学修饰及其相关作用机制研究)等。特别是在成纤维细胞生长因子（FGF)系列为代表的基因工程药物研发方面，开展了大量工作，具有较好的积淀和基础，已建立了国内较全的成纤维细胞生长因子突变与改构体系。
本方向带头人李校堃教授，为长江学者特聘教授，具有2个国家一类新药的研发经验，曾牵头组建全国唯一一个基因工程药物国家工程技术研究中心，并担任副主任、首席科学家，因其在FGF研发方面的突出成绩，2010年3月作为中国唯一代表受邀参加了最有影响的国际会议之一——高登研究会议之FGF会议并做主题报告，系统介绍了中国FGF研究的情况。
本方向拥有一支水平高、结构合理的人才梯队，队伍中包括长江学者特聘教授、教育部新世纪优秀人才、国家新世纪百千万人才等。目前，本方向方向有正高职称4人，副高6人，具有博士学位者8人。
目前，初步形成了生物技术药物的开发与临床研究、生物新药的基因工程与蛋白质工程研究、生物药物分子结构与功能研究等3个稳定的方向。
本方向建有浙江省生物技术制药工程重点实验室、国家新药开发工程技术研究中心制剂工程基地等，并获得浙江省重中之重学科4000万元建设资金支持，目前拥有开展本方向研究所需的各类仪器设备。
获得863计划项目、国家自然科学基金项目支持，发表学术论文56篇，其中SCI收录31篇。出版学术专著2部，其中包括我国第一部全面介绍FGF基础与应用研究的专著。
由于在生长因子研发方面的突出成绩，本方向先后荣获2008年中华医学科技一等奖、2009年国家技术发明二等奖等重大科研奖励。
