同中毒性菌痢应与下列病症相鉴别：
（一)高热惊厥 此症多见婴幼儿，既往多有高热惊厥且反复发作史，常可寻找出引起高热惊厥的病因及诱发因素。一经退热处理后惊厥即随之消退。
（二)中毒性肺炎 此种肺炎病前多有受凉史，多伴感染性休克肺炎症状与体征，出现较早，胸部X光片提示肺部感染证据。无典型肠道感染的临床表现。粪便（包括肛试)检查无特殊发现。
（三)流行性乙型脑炎（简称乙脑)夏秋季节发生的中毒性菌痢需同乙脑相鉴别。乙脑的中枢神经系统症状出现有个过程，其极重型亦需2～3天，较中毒生菌痢为晚。粪便（包括肛试与灌肠)镜检无异常；细菌培养阴性。脑脊液检查呈病毒性脑膜炎改变；乙脑病毒特异性抗体IgM阳性有诊断价值。
（四)脑型疟疾 需与脑型毒痢相鉴别。来自疫区，结合发病季节，以间歇性突发性发冷、发热、出汗后退热的临床特征，血片或骨髓片中找到疟原虫可确诊。
（五)脱水性休克 主要因频繁吐泻史所致低血容量性休克。先有脱水，后发生休克。脱水一旦被纠正休克即随之纠正。
（六)重度中暑 有高温接触史。肛温超高热，皮肤灼热无汗，可伴抽搐、昏迷等神经系统症状，但无定位体征。将患者移至阴凉通风处，病情可迅速缓解。外周血象、粪便与脑脊液检查无异常。
慢性菌痢应同下列疾病相鉴别
（一)慢性阿米巴痢疾 其鉴别要点与急性期大致相同。
（二)慢性非特异性溃疡性结肠炎此病患者一般状况较差，症状迁延不愈，抗生素治疗无效。粪便培养多次均无致病菌。肠粘膜出血点、质脆，接触易出血。钡灌肠或全消化道钡透检查，肠粘膜皱纹消失，晚期结肠袋消失，结肠变短，管腔狭窄为其特征。
（三)肠结核 多继发于肺结核，痰抗酸染色或24小时痰浓集法可查见结核杆菌，肠道病变多在回盲部，故右下腹压痛或扪及肿块，钡剂灌肠X线检查有助于诊断。
（四)直肠癌、结肠癌 多见于中老年人，并发局部感染时酷似菌痢，需依据肛门直肠指诊、肠镜及肠粘膜活检等手段确诊。
(五)肠道菌群失调 由于滥用抗药物或者广谱抗药物使用时间较长，易引起菌群失调。主要为肠道杆菌减少或消失，代之金葡萄、真菌（主要为白色念珠菌)及某些革兰阴性菌或厌氧菌感染，表现炎腹泻不愈，大便性状可因病原不同而异，以乳幼儿、年老体弱者多见。医学全在线网站www.med126.com
[预后]
急性菌痢一般预后良好，发病后1周出现免疫力，2周左右可痊愈。少数患者可因治疗不当或不及时，或因体质衰弱等因素，转变为慢性或遗有肠功能紊乱。中毒型菌痢因诊治不及时，病死率高。极少数危重患者因脑组织损伤严重，可发生中毒性脑病，与此同时遗不同程度的神经精神症状。
[治疗]
（一)急性菌痢的治疗
1．一般治疗 卧床休息、消化道隔离。给予易消化、高热量、高维生素饮食。对于高热、腹痛、失水者给予退热、止痉、口服含盐米汤或给予口服补液盐（ORS)，呕吐者需静脉补液，每日1500ml～3000m。小儿按150～200lml/kg/日，以5%葡萄糖盐水为主。中毒症状严重时可用氢可琥珀酸钠100mg加入液体中静滴，或口服强的松10～20mg，以减轻中毒症状。
2．病原治疗 由于耐药菌株增加，最好应用≥2种抗菌药物，可酌情选用下列各种药物：
（1)磺胺类：磺胺甲基异恶唑（SMZ)加甲氧苄胺嘧啶（TMP)，即复方新诺明（SMZco)，1.02次/日，首次加倍，儿童50mg/kg/日，连用5～7日。
（2)喹诺酮类：为人工合成的广谱抗菌药物，作用于细菌DNA旋转酶，阻止DNA合成，有杀菌效果。此外组织渗透性强，少有耐药产生。①吡哌酸（PPA)0.53次/日或1.02次/日，连用5～7日。②氟哌酸（NFLX)0.4，2～3次/日。③氟啶酸（ENX)0.1，3次/日，小儿酌减。
（3)抗生素：可适当选用庆大霉素（8万u2次/日，小儿3000～5000u/kg/日，或卡那霉素0.52次/日)肌注或静滴，疗程均为5～7日。还可选用丁胺卡那霉素、磷霉素及头孢菌素类等。
（4)利福平：对痢疾杆菌也有一定杀灭作用。
3中医中药治疗：①辨证论治：表未解里热已盛者应表里双解，用葛根黄连汤加减；湿重于热者应利湿清热，用胃苓汤加减；热重于湿者应清热利湿，用白头翁汤加减；湿热互滞者用芍药汤加减。②黄连素0.4g，每日3次，儿童30 mg/kg/日，连用5～7日。生大蒜口服。③亦可选用马齿苋、地榆、苦参、地锦草等单方草药煎汤口服，早晚各一次。
4．针刺：取天枢、气海、关元、足三里或止痢穴（左下腹相当于麦氏压痛点部位)。配止泻、曲地、阳陵泉等强刺激，不留针。
