诊断
早期诊断很重要并需要认识高危因素(特别在低出生体重的新生儿)。任何新生儿在生后数周内的表现偏离正常时应高度怀疑败血症。若护士或父母讲到婴儿"不太好"或出现明显的或轻微的败血症体征时，应立即进行检查。以下的实验室检查可提供诊断性材料。
白细胞计数，分类和涂片 新生儿的正常白细胞计数是有变化的，但＜4000/μl或＞25000/μl是异常的。带状核白细胞绝对计数并不敏感到可预见新生儿败血症。未成熟多叶核白细胞/总多叶核白细胞的比率＜0.2，可准确地排除细菌性败血症。嗜酸性细胞绝对计数的突然下降和中性粒细胞的变形(中毒颗粒，Dohle小体，在不含枸橼酸的血中或乙二乙胺的血中有胞浆内空泡形成)可提示败血症。
血小板计数 血小板计数在临床败血症发生前数小时至数日出现下降，但常在婴儿表现患病后1日左右停留在增高的水平，有时伴弥漫性血管内凝血的其他异常(如纤维蛋白降解产物的升高，纤维蛋白原降低和凝血酶原时间延长)。
血棕黄层检查 由于败血症新生儿血中有大量循环的细菌，对血的棕黄层用革兰氏，美蓝或丫啶橙染色，常可在多核中性粒细胞中或其有关部位发现病原菌。
腰椎穿刺 对已有缺氧的婴儿作腰穿有加重缺氧的危险，因此并不鼓励对稍有怀疑为败血症的新生儿常规作腰穿。但怀疑婴儿有败血症，在病情稳定并能承受操作时应立即作腰穿(见下文新生儿脑膜炎)。由于生后第1天GBS肺炎的临床表现容易和肺透明膜病混淆，因此常在怀疑此病的新生儿中常规作腰穿。
血培养 脐血管，特别在经过数小时后，常被脐带残端上的细菌污染；因此用脐血作培养可能不可靠而应通过静脉穿刺抽血，最好选择两处外周静脉抽血，每处必须先涂含碘液体，而后是95%的酒精，让其自然干燥。血必须同时作需氧菌和厌氧菌培养(脆弱杆菌需要特殊的培养条件来鉴别)，如果考虑败血症与插管有关，应通过插管取血并经周围取血作培养。在＞90%的阳性血培养中，细菌生长出现在培养的48小时内，50%的阳性血培养标本含有＞50个菌落-形成单位(CFU)/ml，但只有＞1000CFU/ml才会有发生脑膜炎的危险。因为高密度的菌血症，少量血(如1ml)就足以检出病原体。毛细血管血培养的资料不足故不推荐它的应用。
念珠菌能在血培养和血琼脂平板上生长；然而如果怀疑有其他真菌存在，必须用特殊的培养基。真菌培养需4～5日才会有阳性结果，而且有时即使有明显的全身性播散感染结果仍是阴性。在得到培养结果之前，确定菌丛的定植是有帮助的(在口腔，大便或皮肤)，如果怀疑有播散型念珠菌感染，可在扩瞳后用间接检眼镜寻找与播散型念珠菌感染一致的视网膜损害。用肾脏超声检测肾脏的足分支菌病。
尿分析和培养 尿液应从耻骨上穿刺抽取而不是从集尿袋中获得。离心尿镜检每个高倍视野发现5个以上白细胞，或在未离心尿经革兰氏染色发现细菌，都证明是泌尿道感染，在新生儿提示在这以前有菌血症(新生儿败血症)，缺乏脓尿并不能排除泌尿道感染。
对流免疫电泳和乳胶凝集试验 这些检查检测体液中的抗原(如脑脊液，浓缩尿)，也可检测GBS，大肠杆菌K1(B型淋球菌脑膜炎)，肺炎球菌和B型流感嗜血杆菌的荚膜多糖抗原。
急相反应物 这些蛋白质是在任何原因引起的炎症情况下，由肝脏在白介素-1刺激下产生。其中最有价值的是定量C-反应蛋白。在C-反应蛋白的浓度为1ml/dl(用比浊法测定)时，假阳性率和假阴性率为大约10%。发病的第1日内开始升高，第2～3日达到高峰。在婴儿临床痊愈的第5～10日降至正常。
其他炎性试验 微量血沉与标准的Wintrobe法相关良好，但假阴性率高(特别在弥漫性血管内凝血的早期)，较慢恢复至正常，超过临床痊愈的时间。白介素-6和其他炎性细胞因子作为败血症的标志正在研究中。
筛查方案 一些研究者建议联合使用上述某些检查。通常不成熟PMN/总PMN比率(＞0.2为异常)加上血，脑脊液，尿培养与其他的多项结合检查具有相同的用处，阴性结果可准确地诊断97%未感染婴儿。
用预防剂母亲分娩的新生儿的检测 评价需要全部诊断性工作，包括全血细胞计数及分类，血培养，胸片(如果出现呼吸道体征)，如果怀疑或有败血症证据出现，应作腰穿(内科医生斟酌决定)和开始给予经验性治疗。美国儿科学会建议如果婴儿无任何败血症体征但胎龄＜35周，或如果母亲在分娩前接受了两剂分娩期抗生素应用，作限制性评价(全血细胞计数和血培养至少需要24小时观察)。
预后
低出生体重儿败血症死亡率比足月儿高2～4倍；早发型败血症的总死亡率是15%～50%(早发型GBS感染为50%～80%)，晚发型败血症则为10%～20%(晚发型GBS感染大约为20%)。
新生儿同时患败血症和粒细胞减少症者很少存活，特别是如果他们骨髓中性粒细胞贮存池(NSP)缺失达全部中性粒细胞的7%以下(死亡率为90%)。由于骨髓中性粒细胞贮存池水平不易测得，通常用外周未成熟：总体中性粒细胞的比率(I:T)来近似反应骨髓中性粒细胞贮存池水平。I:T比率＞0.8与中性粒细胞贮存池耗尽及死亡相关。因此这个比例可帮助确定患儿是否会从输注粒细胞中得益(见下文治疗)。
