1．营养 各种寄生虫所需的营养成分基本相同，如碳水化合物、蛋白质、脂肪、维生素和微量元素等。原虫类寄生虫所必需的营养物质大多与一般动物的相同，有以单糖为主的葡萄糖、氨基酸、碱基及核苷（nucleoside)、脂肪酸，以及维生素和微量元素等。一般而言，原虫从细胞外获得营养的方式包括简单扩散（simple diffusion)、易化扩散（facilitated diffusion)、主动转运 （active transport)和内胞噬 （endocytosis)等。有胞口的原虫，如结肠小袋纤毛虫（Balantidium coli)，从胞口获取营养。有伪足的原虫，如溶组织内阿米巴，吞噬食物后在胞质内形成食物泡再消化吸收。
有的蠕虫有消化道，有的没有。前者如线虫，主要从消化道摄取和吸收营养物质。后者如绦虫，主要借助体壁吸收营养物质。
2．代谢 寄生虫的代谢主要是能量代谢，包括合成和分解代谢。大多数生物能量代谢的本质是将营养源内的葡萄糖等分子内的化学能量转变为ATP。寄生虫的能量来源主要是通过糖酵解获得的。由于寄生环境及其含氧量的差异，使得寄生虫在能量转化过程中采取的呼吸方式也不同。例如蛔虫的能量生成系统包括从感染期幼虫的有氧呼吸至成虫的以延胡索酸接受电子的无氧呼吸的动态转换。感染期幼虫生活在氧分压高的外界环境中，行有氧呼吸，即葡萄糖经酵解和三羧循环（tricarboxylic acid cycle，TAC)分解，生成大量的ATP。而当感染期幼虫进入人体后，在氧分压相对较低的小肠内发育为成虫，则通过延胡索酸呼吸也可获得较高数量的ATP。延胡索酸呼吸系统是一种重要的获得能量的方式，除蛔虫外，其他许多蠕虫和原虫也采取这种方式。寄生于宿主红细胞内的疟原虫，寄生于肠道内的蓝氏贾第鞭毛虫和溶组织内阿米巴等主要通过糖酵解产生ATP。
合成代谢方面，虽然寄生虫的生长、繁殖需要高速率的合成代谢，但由于其所需要的营养成分主要来自宿主，因此大多数寄生虫的合成代谢种类十分有限。如寄生蠕虫大多不能合成胆固醇和不饱和脂肪酸，缺乏从初始阶段合成脂类的能力。多数原虫也不能合成胆固醇。
核苷酸代谢：寄生性原虫和蠕虫缺乏嘌呤初始的合成途径，完全依赖执业药师补救途径。大多数寄生虫自身不能合成嘌呤，而是依赖宿主体内含量丰富的碱基、核苷来适应嘌呤合成途径。与嘌呤的合成途径不同，嘧啶的合成可通过从头合成途径和补救途径同时发挥作用，如锥虫、疟原虫和弓形虫均是如此。
氨基酸代谢：有的原虫，如罗得西亚锥虫，可以从碳水化合物代谢的中间产物之一即磷酸烯醇丙酮酸，合成多种氨基酸（甘氨酸、丝氨酸、天门冬氨酸、谷氨酸)。原虫氨基酸的分解代谢因虫种不同而有所差异，如溶组织内阿米巴先将甘氨酸转变成丙酮酸，再参与能量代谢。有些原虫，如非洲锥虫、利什曼原虫在媒介昆虫体内，利用脯氨酸作为能量来源。蠕虫则以主动吸收的方式从宿主获得氨基酸。关于蠕虫氨基酸的分解代谢尚不清楚。
