厦门大学研究生教育具有自己的优势和特色。 1986 年，厦门大学成立研究生院。 1996 年 3 月，原国家教委正式批准厦门大学建立研究生院，是全国首批建立研究生院的 33 所高校之一。
优良的培养质量
厦门大学研究生教育的培养目标是培养适应 21 世纪的高素质创新型人才。学校始终以 “ 提高研究生培养质量 ” 为核心，通过实施研究生教学质量工程，加强学科建设，深化教学与课程改革，积极探索新的培养模式，重点培养研究生的创新能力和实践能力，全面提高研究生培养质量，其主要内容包括：研究生实验教学与科研创新平台建设工程、优质课程建设工程、博士论文培育工程，研究生国内外访学交流与学术论坛计划，研究生教育程序化管理与质量监控工程及学科建设与学位点建设工程等。
灵活的培养机制
为加速优秀研究生的培养，厦门大学在部分专业试行硕博贯通的“直博生”培养方式，加大提前攻博与硕博连读研究生的选拔力度，吸引和开拓优秀博士生生源；实行弹性学制，硕士研究生 2-3 年；博士研究生 3-4 年；硕博连读与本直博研究生 5-6 年。 适当放宽研究生的在校年限，让他们有充足的时间去进行创新意义较大的研究，有利于优秀人才脱颖而出。
完善的激励机制
在校研究生可以通过多种渠道获得经济资助：学校设有各类奖、助学金，学校拨出专款设立研究生 “ 助教、助研、助管 ” 三助岗位等等。学校将积极争取在部分学院试行奖学金制度改革，推行高额滚动式奖学金。
招收培养国际项目硕士研究生
学校计划从 2006-2007 学年开始在部分学院面向海外生招收培养国际项目硕士研究生。 我校将在文学院、经济学院、法学院、化学化工学院、生命科学学院和海洋与环境学院等六学院推行研究生国际项目，全部课程用英语授课，吸引外国留学生到我校攻读硕士学位，使他们更好地了解中国，为他们在中国发展创造良好条件，并将成为学校今后研究生培养的一个重点该项目。该项目 旨在培养 既具有良好的专业基础，又了解中国社会与文化的高层次国际专业人才，培养模式采用全日制和非全日制学习方式相结合。
