在发展中或不发达国家，可以发生中枢神经系统的蠕虫感染，引起炎症性囊肿性疾病。在西半球，最常见的是猪囊虫病(参见第161节绦虫病中猪肉绦虫感染)。脑内许多小的囊尾蚴平时不引起症状，但等到它们死亡时会激发局灶性炎症，胶质增生，水肿以及局灶性神经功能障碍，抽搐发作或阻塞性脑积水。如果囊肿破裂其内容物进入脑脊液则可引起亚急性嗜酸细胞性脑膜炎。最常见的临床表现是抽搐发作，可用抗痫药物加以控制。是否需要长期的抗痫药物治疗根据寄生虫持久的程度以及脑内是否已形成肉芽肿而定。通过宿主的免疫反应或应用药物使寄生虫破坏可显著地减少癫痫发作的频率。阿苯达唑(肠虫清)是首选药物，15mg/kg，每12小时1次分次服用，连用8～30天；每天最高剂量为800mg。可选用的另一个药物是吡喹酮，50mg/(kg.d)分3次服用，可连用15天。在开始的2～4天，应用地塞米松8mg/d，静脉注射或口服，可减轻囊虫死亡时引起的急性炎症性反应。

在血吸虫病中(参见第161节吸虫病)，脑内坏死性嗜酸性肉芽肿可引起抽搐发作，颅内压增高以及弥漫与局灶的神经症状。巨大的，孤立的包虫病囊肿(参见第161节绦虫病中的包虫病)可引起局灶性症状，以及偶尔抽搐发作。多头蚴病通常形成葡萄串状囊肿，后者可引起脑脊液自第四脑室外流的阻塞。