慢性肾炎需与下列疾病作鉴别：
一、慢性肾盂肾炎 慢性肾盂肾炎晚期查有明显蛋白尿和高血压与慢性肾炎相似，但慢性肾盂肾炎多见于女性，病史中有泌尿系感染史，尿沉渣检查白细胞数较多，甚或有白细胞管型，如涂片能找到细菌或尿培养阳性更有助于诊断。慢性肾盂肾炎患者的肾功能损害以肾小管损害为主，尿蛋白具有肾小管性蛋白（小分子量蛋白)的特征。静脉肾盂造影，同位素肾图及肾扫描，呈两侧肾脏损害不对称，可作为鉴别诊断的重要依据。
二、原发性高血压 久病高血压亦引起肾脏损害，出现尿异常改变。但尿蛋白量常较少，罕有持续性血尿及红细胞管型。一般无贫血及低蛋白血症，如有肾功能损害，其程度也不如慢性肾炎严重。鉴别原发性高血压与慢性肾炎高血压型，病史很重要，前者高血压病史在先，而后者则先有蛋白尿，亦可行肾活组织检查鉴别。
三、与继发于全身疾病的肾损害鉴别 不少全身性疾病引起继发性肾损害，其表现似慢性肾炎。如过敏性紫癜性肾炎、糖尿病肾病、痛风性肾病、多发性骨髓瘤、感染性心内膜炎等，与慢性肾炎的鉴别可参见有关章节。
治疗
迄今尚无满意的治疗方法，多为对症施治。
一、一般治疗 鼓励病人树立战胜疾病信心、防止感染，加强休息，避免强体力活动，但要做适当有益活动。
二、水肿 高血压或肾功能不全者，要限制钠的摄入量，适当控制饮水量，对有大量蛋白尿，患者应提高蛋白质摄入量。肾功能不全者，则应给予优质蛋白质，每日40g左右。总热量应在146.44kj/kg（35佧／公斤体重)左右。除高脂血症者外，脂肪不限，应给足够维生素。
三、利尿剂的应用 轻度浮肿不必给利尿剂，中度以上浮肿者可按病情选用噻嗪类药物，保钾利尿剂（安体舒通、氨苯喋啶)或速尿，可单独或联合应用，剂量宜由小到大，逐渐消肿以防止电解质紊乱。
四、降血压 血压高于21.5/13/5kpa,应给予降压药物，降压药物的应用参见有关章节。
五、抗凝疗法及抗氧化剂的应用 参见急性肾炎一节。
六、中医中药治疗 可选用下列中草药或方剂治疗，如金钱草、板兰根、败酱草、蒲公英、当归、丹参、桃仁、红花等，具有清热解毒、消肿利尿、活血化瘀等功效。
七、联合疗法 慢性肾炎使用单一药物治疗，疗效常不满意，联合疗法采用抗凝药物（肝素、潘生丁)、抗氧化剂（大剂量维生素E、SOD)、中药（活血化瘀、清热解毒、利尿消肿)及对症施治，可提高疗效。
预后
慢性肾炎病情发展快慢，与病因、病理类型，机体的反应性及医疗监护等条件有关。慢性肾炎可因医疗监护不当，反复急性发作，经2－3年即进入肾功能衰竭期，有些患者的病情比较稳定，历经20－30年后才发展成肾功能衰竭。
